结论：将综合工时制下每天的工作时间由12小时调整为8小时，这一调整本身是合法的，但具体是否合法还需考虑调整过程是否遵循了相关法律法规和劳动合同的约定。
法律分析：
综合工时制的基本规定：
- 综合工时制是一种特殊的工作时间安排制度，它允许员工在某些工作日内工作超过标准工时的8小时，但在一个特定的周期（如周、月等）内，其总工作时间不应超过该周期内标准工时制的总工作时间。这种制度的实施必须经过劳动行政部门的批准。
工作时间调整的合法性：
- 调整过程合法：如果用人单位在调整工作时间时，与劳动者进行了充分的协商，并取得了劳动者的同意，同时确保调整后的工作时间仍然符合综合工时制的总工时要求，且已经获得了劳动行政部门的批准或备案，那么这种调整是合法的。
- 调整过程违法：如果用人单位单方面决定调整工作时间，没有与劳动者进行协商或未取得劳动者的同意，或者调整后的工作时间违反了综合工时制的总工时要求，或者未获得劳动行政部门的批准或备案，那么这种调整就是违法的。
劳动者权益保护：
- 无论工作时间如何调整，用人单位都应确保劳动者的整体权益不受损害，包括工资待遇、休息休假权益等。如果调整工作时间导致劳动者的工资收入降低或休息休假权益受到影响，用人单位应给予相应的补偿或调整。
具体建议：
对于用人单位：
- 在调整工作时间前，应与劳动者进行充分的协商，确保调整方案得到劳动者的同意。
- 确保调整后的工作时间仍然符合综合工时制的总工时要求，并及时向劳动行政部门进行批准或备案。
- 如果调整工作时间对劳动者的权益产生了影响，应给予相应的补偿或调整。
对于劳动者：
- 如果用人单位提出调整工作时间，应积极参与协商，表达自己的意见和诉求。
- 如果认为调整后的工作时间违反了法律法规或劳动合同的约定，可以向劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
可能后果：
- 如果用人单位违法调整工作时间，可能会面临劳动行政部门的警告、责令改正以及罚款等处罚。
- 劳动者也有权要求用人单位支付因违法调整工作时间而产生的加班费或其他形式的补偿。
综上所述，将综合工时制下每天的工作时间由12小时调整为8小时，这一调整本身并不违法，但关键在于调整过程是否合法合规。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。