在劳动仲裁期间，如果单位停缴了您的社保，关于您是否可以单独只交医保的问题，这主要取决于您所在地区的具体社保政策和规定。不过，我可以根据一般情况和相关政策原则，为您提供一个较为详细的解答。

首先，我们需要明确的是，社会保险通常包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险等多个险种，这些险种一般是捆绑缴纳的，即单位和个人需要共同缴纳所有险种或至少缴纳其中的一部分。然而，在某些特定情况下，如离职后、灵活就业等，个人可能有机会选择单独缴纳某些险种，但这通常受到地区政策的限制。

针对您的情况，如果单位在劳动仲裁期间停缴了您的社保，您想要单独缴纳医保，这通常不是直接可行的，因为社保的缴纳一般是整体进行的，不是可以随意拆分的。但是，如果您符合当地灵活就业人员的参保条件，您可能有机会以灵活就业人员的身份单独参加职工基本医疗保险。

以深圳市为例，根据《深圳市医疗保障办法》的规定，深户的灵活就业人员是可以参加职工基本医疗保险一档的。这意味着，如果您是深圳市的户籍，并且在劳动仲裁期间处于灵活就业状态，您是有可能单独缴纳医保的。不过，具体的缴费金额和办理流程需要您根据当地的政策规定进行查询和操作。

对于其他地区，您需要咨询当地的社保经办机构或医疗保障部门，了解是否允许灵活就业人员单独缴纳医保，以及具体的缴费标准和办理流程。

另外，如果您在劳动仲裁期间找到了新的工作单位，那么您应该及时将个人参保情况告知新单位，由新单位来为您缴纳社保。在这种情况下，您可能需要先停掉以灵活就业人员身份参加的医保，然后由新单位为您重新办理社保缴纳手续。

总的来说，虽然一般情况下社保是整体缴纳的，但在某些特定情况下，如灵活就业等，您可能有机会单独缴纳医保。不过，这需要您根据当地的政策规定进行查询和操作。如果您有任何疑问或需要进一步的帮助，建议您咨询当地的社保经办机构或医疗保障部门。