结论：病假休三天扣当月绩效是否合理，需根据具体情况判断，包括公司规章制度、劳动合同约定以及病假性质等。以下从不同角度进行分析：
一、公司规章制度与劳动合同约定
公司规章制度：
- 如果公司规章制度中明确规定了病假期间绩效的扣除方式，且该规章制度已经过民主程序制定（如职工代表大会或全体职工讨论通过），并向劳动者进行了公示或告知，那么该规定对劳动者具有约束力。在此情况下，如果病假休三天符合规章制度中规定的扣除绩效的条件，那么公司的做法可能是合理的。
劳动合同约定：
- 劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。如果劳动合同中明确约定了病假期间绩效的扣除方式，且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，也不违背公序良俗，那么该约定对双方均具有约束力。在此情况下，如果病假休三天符合劳动合同中约定的扣除绩效的条件，那么公司的做法也是合理的。
二、病假性质与法律规定
病假性质：
- 病假是劳动者因患病或非因工负伤需要停止工作医疗时，用人单位应当给予的医疗期。在医疗期内，劳动者享有相应的病假工资和福利待遇。如果病假休三天属于医疗期内的正常病假，那么公司扣除当月绩效可能缺乏合理性，除非有明确的规章制度或劳动合同约定支持。
法律规定：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》等相关法律法规，劳动者在医疗期内享有病假工资和福利待遇，且用人单位不得随意解除劳动合同。虽然这些规定并未直接涉及病假期间绩效的扣除问题，但可以从侧面反映出法律对劳动者医疗期权益的保护。如果公司扣除绩效的做法损害了劳动者的合法权益，那么可能构成违法。
三、实际操作建议
审查公司规章制度和劳动合同：
- 劳动者应首先审查公司的规章制度和劳动合同，了解其中关于病假期间绩效扣除的规定。如果规定不明确或存在争议，可以与公司进行沟通协商。
与公司沟通协商：
- 如果劳动者认为公司扣除绩效的做法不合理，可以与公司进行沟通协商，寻求解决方案。在协商过程中，劳动者可以提出自己的诉求和理由，并要求公司提供相应的依据和解释。
寻求法律援助：
- 如果沟通协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。在投诉或申请仲裁时，劳动者需要提供相关证据和材料，以支持自己的诉求。
举例说明：假设某公司规章制度中规定，员工病假超过两天将扣除当月绩效的50%。如果某员工因病请假三天，且该规章制度已经过民主程序制定并向员工进行了公示或告知，那么公司扣除该员工当月绩效的50%可能是合理的。但如果公司规章制度中并未规定病假期间绩效的扣除方式，或者规定与劳动合同约定相冲突，那么公司扣除绩效的做法可能缺乏合理性。
进一步思考：在实际操作中，公司扣除病假期间绩效的做法可能引发劳动争议。因此，建议公司在制定规章制度和劳动合同时，应充分考虑劳动者的合法权益和实际情况，避免制定过于苛刻或不合理的规定。同时，劳动者也应增强法律意识，了解自己的权益和义务，以便在发生争议时能够及时维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。