针对您提出的“在事业单位聘用十五年只交十二年医保是否合法”的问题，这主要涉及到职工医保缴费年限的法律规定以及地方政策的具体执行。以下是我为您提供的详细解答：
一、国家关于职工医保缴费年限的法律规定
根据《中华人民共和国社会保险法》第二十七条的规定，参加职工基本医疗保险的个人，在达到法定退休年龄时，如果累计缴费达到国家规定年限，退休后将不再需要缴纳基本医疗保险费，并可以按照国家规定享受基本医疗保险待遇。如果未达到国家规定年限，个人可以选择继续缴费至规定年限。
二、地方政策对职工医保缴费年限的具体规定
由于国家层面并未明确具体的缴费年限，因此各省会根据自身的人口老龄化、基金运行情况等因素来合理确定本省的职工医保缴费年限要求。以湖南省为例，其规定参保人员的累计缴费年限（含视同缴费年限、实际缴费年限）不得低于男满30年、女满25年，其中在本省范围内的实际缴费年限不得低于一定年限（该年限在逐步调整，2025年为12年，2028年将达到15年）。
三、针对您具体情况的分析
聘用年限与医保缴费年限的关系：您在事业单位聘用了十五年，但只缴纳了十二年的医保。这并不意味着单位的行为一定不合法，因为具体是否合法还需参考您所在省份的具体政策规定。
地方政策的适用性：如果您所在的省份规定的实际缴费年限要求低于或等于十二年，那么单位的行为就是合法的。但如果规定的实际缴费年限要求高于十二年，那么单位可能未完全履行其缴纳医保的义务。
单位责任与义务：根据相关政策，单位有责任和义务为其职工缴纳医保至规定年限。如果单位未按规定缴纳，职工有权要求单位补缴或向相关部门投诉。
四、建议与措施
查询地方政策：建议您首先查询您所在省份关于职工医保缴费年限的具体规定，以确定单位的行为是否合法。
与单位沟通：如果发现单位未按规定缴纳医保，您可以与单位的人力资源部门或相关负责人进行沟通，要求单位补缴医保费用。
寻求法律援助：如果单位拒绝补缴或您与单位在医保缴费问题上存在争议，您可以寻求法律援助或向当地劳动监察部门投诉。
综上所述，要判断您在事业单位聘用十五年只交十二年医保是否合法，需要参考您所在省份的具体政策规定。如果您对此有疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询相关部门或专业人士。