在劳动仲裁案件中，关于员工自己承担的社保部分是否算作应发工资的问题，这是一个涉及劳动法规定和工资构成原理的重要问题。以下是我为您提供的详细解答：

一、应发工资的定义与构成

应发工资，简而言之，就是劳动者在提供正常劳动的情况下，按照劳动合同约定或用人单位依法制定的规章制度规定，应当获得的全部劳动报酬。这通常涵盖了基本工资、奖金、津贴、补贴等直接支付给劳动者的货币性收入。根据《关于工资总额组成的规定》第四条，工资总额明确由计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴、加班加点工资、特殊情况下支付的工资六个部分组成，并未将社保和公积金个人缴费部分纳入其中。

二、社保和公积金的性质与用途

社保，即社会保险，是用人单位和劳动者按法律共同承担的社会保障费用，它用于保障劳动者在养老、医疗、失业、工伤和生育等方面的权益。公积金，则是由职工和单位共同缴纳的，专项用于住房消费支出的储金。这两者都具有特定的社会保障和住房保障性质，与直接劳动报酬是相互区分的。

三、劳动仲裁中应发工资的计算原则

在劳动仲裁实践中，当计算经济补偿金、赔偿金等涉及工资标准的情形时，一般是以劳动者的应发工资为基数。这里的应发工资，明确不包括社保和公积金个人缴费部分。这是因为这两部分费用有其特定的性质和用途，它们并不属于劳动者的直接劳动报酬，而是依法应当缴纳的费用。

四、特殊情况与注意事项

当然，也存在一些特殊情况。比如，有些单位可能会为职工提供一些非工资性的福利或补贴，如交通补贴、午餐补贴等。这些一般不计入工资总额，也不包含在应发工资中。但如果这些补贴是以现金形式固定发放，且与职工的工作表现或出勤情况挂钩，那么它们可能会被认定为工资的一部分。另外，如果劳动合同或其他相关文件对工资的构成和计算方式约定不明确，可能会导致对“应发工资”的具体范围产生争议。此时，仲裁机构或法院会根据具体情况，结合相关证据和法律规定进行认定。

五、总结与建议

综上所述，劳动仲裁中的应发工资一般不包含社保和公积金个人缴费部分。这是基于社保和公积金的特定性质和用途，以及相关法律法规的规定。因此，在处理劳动仲裁案件时，我们应严格区分直接劳动报酬和这些特定费用的界限，以确保劳动仲裁的公正性和准确性。如果您在劳动仲裁过程中遇到相关问题，建议咨询专业律师或劳动仲裁机构，以获取更具体、更专业的法律建议。