用人单位在劳动仲裁时承认劳动关系，但一审时又不承认，这种情况下劳动者可以采取以下措施来维护自己的合法权益：

1. 明确劳动关系的认定标准：

   • 根据《关于确立劳动关系有关事项的通知》（劳社部发〔2005〕12号），用人单位招用劳动者未订立书面劳动合同，但同时具备下列情形的，劳动关系成立：
     1. 主体资格合法：用人单位和劳动者符合法律、法规规定的主体资格；
     2. 规章制度适用：劳动者受用人单位的劳动管理，从事用人单位安排的有报酬的劳动；
     3. 业务组成部分：劳动者提供的劳动是用人单位业务的组成部分。
   • 认定双方存在劳动关系时，可参照的凭证包括工资支付凭证或记录、缴纳各项社会保险费的记录、用人单位向劳动者发放的“工作证”“服务证”等能够证明身份的证件、劳动者填写的用人单位招工招聘“登记表”“报名表”等招用记录、考勤记录以及其他劳动者的证言等。

2. 积极收集证据：

   • 直接证据：如劳动合同、工资条、银行流水、工作证、服务证、社保缴纳记录等，这些证据能够直接证明劳动关系的存在。
   • 间接证据：如工作邮件、聊天记录、工作任务分配记录、考勤记录、证人证言等，这些证据虽然不能直接证明劳动关系，但可以结合其他证据形成完整的证据链，证明劳动者实际接受公司的管理和指挥，从事公司安排的有报酬的劳动。

3. 利用举证责任分配规则：

   • 根据法律规定，与争议事项有关的证据若由用人单位掌握管理，用人单位应提供；若不提供，将承担不利后果。例如，考勤记录、工资发放台账等通常由用人单位掌握，若单位不承认劳动关系又拒不提供这些证据，法院或仲裁机构可作出对其不利的认定。

4. 应对一审中的否认：

   • 在一审过程中，用人单位可能提出各种理由来否认劳动关系的存在，如声称劳动者为临时工、实习生或非全日制员工，或者认为双方为合作关系或劳务关系等。
   • 劳动者应针对这些否认理由，提供充分的证据来证明自己实际接受公司的管理和指挥，从事公司安排的有报酬的劳动，且劳动者的工作是公司业务的组成部分，双方存在从属关系。

5. 寻求法律救济：

   • 如果一审法院未支持劳动者的主张，劳动者可以在规定期限内向上一级人民法院提起上诉，通过司法程序进一步维护自己的合法权益。
   • 在整个诉讼过程中，劳动者应始终遵守法律法规和程序规则，确保维权行为的合法性和有效性。

具体行动建议：

• 收集并整理证据：劳动者应尽快收集并整理所有能够证明劳动关系的证据，包括直接证据和间接证据，确保证据的完整性和真实性。
• 咨询并委托律师：由于劳动纠纷涉及复杂的法律程序和专业知识，劳动者可以咨询并委托专业律师来代理案件，以提高维权的成功率和效率。
• 保持冷静和理性：在维权过程中，劳动者应保持冷静和理性，避免情绪化行为，专注于事实和法律依据，以更好地维护自己的合法权益。

示例说明：

假设劳动者小张在劳动仲裁时，用人单位承认了与小张的劳动关系，但在一审时却否认了。小张可以收集自己的工资条、银行流水、工作证、与同事的工作邮件和聊天记录等证据，证明自己实际接受公司的管理和指挥，从事公司安排的有报酬的劳动。同时，小张可以咨询并委托专业律师来代理案件，律师会帮助小张整理证据、起草法律文书，并在一审过程中代表小张发言，针对用人单位的否认理由进行有力反驳。如果一审法院未支持小张的主张，小张还可以在规定期限内向上一级人民法院提起上诉，继续维护自己的合法权益。