结论：公司以工资不够扣为由对超出工资部分进行罚款的做法通常不合法，你朋友有权拒绝不合理扣款，可通过与公司协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维权。以下为详细分析：
从公司罚款合法性角度分析
- 公司罚款权限：根据我国现行劳动法律法规，用人单位一般不具有对员工进行罚款的权力。除非员工因故意或重大过失给公司造成实际经济损失，且公司能够证明该损失与员工行为存在直接因果关系，同时公司规章制度中明确规定了赔偿方式和金额，这种情况下公司才可以要求员工赔偿损失。仅仅因为上班一天就不干且抽烟，公司直接罚款500元缺乏合法依据。
- 抽烟罚款合理性：如果公司所在场所有明确的禁烟规定，且该规定是通过合法程序制定并告知员工的，员工违反规定抽烟，公司可以依据规章制度进行相应处理，但处理方式应当合理合法。罚款500元对于上班一天且可能还未正式建立稳定劳动关系的员工来说，金额过高，不太合理。而且，即便公司有罚款权，罚款金额也不能超过员工当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。
从工资扣除角度分析
- 工资扣除限制：根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。在你朋友工资不够扣500元的情况下，公司不能超出工资范围进行扣除。
- 公司做法违法性：公司以工资不够扣为由，声称要扣你朋友的钱，这种做法违反了上述工资扣除的规定。公司不能因为罚款金额超过员工工资就随意扣款，否则就侵犯了员工的合法劳动权益。
维权建议
- 与公司协商：你朋友可以先与公司进行友好协商，向公司说明相关法律法规，指出公司罚款和扣款行为的不合法性，要求公司停止不合理扣款，并退还已扣除的款项。
- 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，你朋友可以向当地劳动监察部门投诉。劳动监察部门有权对用人单位的违法行为进行调查处理，责令公司改正违法行为，并要求公司退还非法扣除的工资。
- 申请劳动仲裁：你朋友还可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。在仲裁过程中，需要提供相关证据，如劳动合同、工资条、公司罚款通知等，以证明公司的违法行为。劳动仲裁委员会将根据事实和法律作出裁决，维护你朋友的合法权益。