关于您提出的“上班抽烟罚款一千是否合法”的问题，这是一个涉及劳动法与公司规章制度合法性的重要议题。以下是我为您提供的详细分析：
一、公司罚款权的法律基础
首先，我们需要明确的是，罚款本质上是一种行政处罚权。根据《中华人民共和国行政处罚法》的规定，只有具有行政处罚权的行政机关才能在法定职权范围内实施罚款。公司作为民事主体，并不具备法律赋予的行政处罚权。因此，从这一层面来看，公司直接规定对员工抽烟进行罚款，在未满足特定法律条件下，通常是不合法的。
二、公司规章制度的制定与效力
尽管公司不具备行政处罚权，但公司可以基于管理需要设定规章制度。然而，这些制度必须在法律允许的范围内，且不能侵犯员工的合法权益。具体来说，公司在制定、修改或决定直接涉及劳动者切身利益的规章制度时，应当经过职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定。此外，规章制度还需向员工进行公示或告知，确保员工知晓并同意。未经公示或告知的规章制度对员工不产生约束力。
三、罚款金额的合理性判断
即使公司的规章制度经过了民主程序制定并向员工进行了公示或告知，罚款金额的合理性也是一个重要的考量因素。1000元的罚款如果明显过高，超出了合理范畴，那么该规定可能因显失公平而不具有合法性。罚款规定的合理性还需经过民主程序制定，即需经过职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表协商确定。
四、员工权益保护途径
如果公司对抽烟员工进行了不合法的罚款，员工有权采取以下措施来维护自己的合法权益：
与公司协商：员工可以首先与公司进行协商，要求返还罚款或调整罚款金额。
向劳动监察部门投诉：如果协商不成，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，寻求行政部门的帮助。
申请劳动仲裁：员工还可以向劳动仲裁机构申请劳动仲裁，通过法律途径来维护自己的权益。
诉讼途径：在极端情况下，如果其他途径都无法解决问题，员工甚至可以通过诉讼途径来保护自己的权益。
五、综合判断与建议
综上所述，公司规定抽烟罚款1000元是否合法，关键在于公司的规章制度是否满足以下条件：经过民主程序制定、向员工公示或告知、罚款金额合理且不显失公平、不侵犯员工的合法权益。只有当这些条件都满足时，公司的罚款规定才可能具备合法性。
因此，我建议您首先查阅公司的规章制度，了解其中关于抽烟罚款的具体规定。如果认为该规定不合法或不公平，您可以与公司进行协商，或者向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在处理此类问题时，保持冷静和理性至关重要，同时了解相关法律法规和公司规章制度也是维护自己权益的关键。