结论：公司使用两个不同的主体与劳动者分别签订劳动合同和劳务合同，这种做法的合法性不能一概而论，需根据具体情况来判断。
一、合法情形
基于合同自由原则：
- 劳动合同和劳务合同是两种不同的合同类型，分别受到《劳动合同法》和《民法典》的调整。只要两份合同的内容均不违反法律法规的强制性规定，且双方自愿签订，那么从合同形式上看，这种做法并不违法。
- 实例解释：例如，劳动者与一家公司签订劳动合同，担任全职工作；同时，利用业余时间与另一家公司签订劳务合同，提供非全日制的兼职服务。如果这两份合同的内容均合法，且劳动者能够合理安排时间，不影响两份工作的完成，那么这种做法是合法的。
非全日制用工的灵活性：
- 如果劳务合同属于非全日制用工形式，那么劳动者可以与一个或多个用人单位订立劳务合同，工作时间灵活，可从事不同兼职工作。
- 实例解释：劳动者在主要工作之余，通过线上平台为其他企业提供非全日制的咨询服务，并签订劳务合同。只要这份劳务合同不影响主要劳动合同的履行，且双方均知情并同意，那么这种做法是合法的。
二、违法情形与风险
对完成本单位工作任务造成严重影响：
- 如果劳动者因同时签订两份合同而无法全身心投入任一工作，导致对其中一家用人单位的工作任务产生严重负面影响（如频繁迟到早退、无法按时完成任务、工作质量下降等），那么用人单位有权依据《劳动合同法》的相关规定解除劳动合同。
- 实例解释：劳动者同时与两家公司签订劳动合同，且均要求全职工作。由于时间冲突，劳动者无法同时满足两家公司的工作要求，导致其中一家公司的工作任务受到严重影响。此时，该公司有权解除与劳动者的劳动合同。
用人单位提出反对意见：
- 即使劳动者签订的两份合同暂时未对工作产生影响，但若用人单位发现并提出反对意见，要求劳动者解除与其他单位的劳动关系，而劳动者拒绝改正，那么用人单位同样可依据《劳动合同法》的相关规定解除劳动合同，且无需支付经济补偿。
- 实例解释：劳动者与一家公司签订劳动合同后，又与另一家公司签订劳务合同。原用人单位发现后，书面通知劳动者停止兼职行为，否则将解除劳动合同。但劳动者未按要求停止兼职，此时原用人单位可依法解除合同。
社保缴纳与税务问题：
- 如果劳动者同时与两家公司签订劳动合同或劳务合同，可能导致社保缴纳和税务处理出现问题。因为按照国家规定，一个人在同一时间只能在一个地方缴纳社保。如果两家公司都为劳动者缴纳社保，可能会引发冲突；如果都不缴纳，则劳动者的社保权益将受到损害。
- 税务风险：签订两份合同还可能导致工资发放混乱和税务处理复杂。劳动者需要确保两家公司都能按时足额发放工资，并正确申报个人所得税。否则，可能面临工资拖欠或税务纠纷的风险。
合同内容冲突与违约责任：
- 如果两份合同的内容存在冲突或矛盾之处（如工资、工作时间等不一致），或者其中一份合同存在不合法之处（如违反竞业限制等），那么可能引发法律纠纷。
- 违约责任：如果劳动者因签订两份合同而给其中一家公司造成损失，可能需要承担相应的赔偿责任。
三、法律建议
谨慎签订合同：
- 在签订两份合同前，劳动者应充分了解相关法律规定和公司的规章制度，确保自己的行为合法合规。
提前沟通并取得同意：
- 如需同时从事多份工作，劳动者应提前与用人单位沟通并取得同意，确保不会对工作任务造成严重影响。
妥善保管证据材料：
- 劳动者应妥善保管好相关证据材料（如合同文本、工资条、考勤记录等），以便在发生争议或纠纷时维护自己的合法权益。
及时咨询法律专业人士：
- 如果面临法律纠纷或疑问，劳动者应及时向我咨询，以获取具体的法律帮助和指导。
综上所述，公司使用两个不同的主体与劳动者分别签订劳动合同和劳务合同的合法性取决于具体情况。劳动者在签订两份合同时应谨慎考虑上述因素，确保自身行为符合法律法规的要求，避免不必要的法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。