结论：公司可以批准员工提前离职并安排交接，但需注意以下法律要点和操作细节，避免引发劳动纠纷。

1. 法律层面：提前离职的合法性

根据《劳动合同法》第三十七条，员工提前30日以书面形式通知公司即可解除劳动合同（试用期员工提前3日）。若员工申请两个月后离职，公司有权批准其提前离职（如双方协商一致），但需注意：

• 员工单方解除权：若员工未与公司协商一致，仍需按法定30日通知期离职，公司无权强制要求其提前；
• 协商一致解除：若双方达成一致（如员工同意提前离职、公司同意缩短交接期），可签订书面协议明确离职日期、工资结算、工作交接等事项，避免后续争议。

2. 操作层面：提前交接的合理性

公司可要求员工提前办理交接，但需满足以下条件：

• 不损害员工权益：提前离职不得影响员工已工作期间的工资、奖金、年假等结算；
• 交接内容明确：需列明需交接的工作、资料、设备等，并由双方签字确认完成情况；
• 替代人员安排：若因提前离职导致公司损失（如未完成项目），公司可要求员工配合过渡，但不得以“扣工资”“不办离职”等威胁员工。

3. 风险防范建议

• 书面协议：无论员工是否同意提前离职，均建议签订《解除劳动合同协议书》，明确离职日期、经济补偿（如有）、保密义务等；
• 工资结算：提前离职时，公司需一次性结清工资、加班费、未休年假工资等，不得拖欠；
• 离职证明：公司应在离职时出具离职证明，载明劳动合同期限、工作岗位、离职日期等信息。

4. 特殊情况处理

• 员工拒绝提前离职：若员工坚持按原计划（两个月后）离职，公司需尊重其法定权利，不得强制要求提前；
• 公司急需交接：可与员工协商缩短交接期，或安排临时人员协助，但需支付相应劳动报酬。

总结：公司可批准员工提前离职并安排交接，但需以协商一致为前提，并严格遵守法律规定。如有具体操作疑问，可进一步向我咨询。