要发现残疾证是否被公司占用，这确实是一个需要谨慎处理且涉及个人隐私保护的问题。以下是一些详细且合法的途径，帮助您进行查询和确认：
一、公司内部途径
直接询问人事部门：
- 您可以首先向公司的人事部门或人力资源负责人提出明确的询问，了解公司是否持有、使用或存储了您的残疾证信息。
- 在询问时，您可以表达对个人信息安全和隐私保护的关切，并要求公司提供相关的证明或解释，比如是否在残疾人就业登记、税收优惠等方面使用了您的残疾证。
查阅公司相关文件：
- 仔细检查公司的员工手册、隐私政策、劳动合同或其他相关文件，确认是否有关于残疾证信息收集、使用和存储的明确规定。
- 如果文件中没有明确说明，或者您对文件中的内容有疑问，可以向公司法务部门或管理层提出质疑，并要求他们给出明确的答复。
二、外部机构与政务平台途径
登录政务平台查询：
- 您可以通过实名认证登录当地的政务服务网、残疾人就业服务平台等官方网站，查找与自己残疾证使用相关的信息。
- 这些平台通常会提供残疾人就业登记、税收优惠等信息的查询服务，您可以根据这些信息来判断公司是否使用了您的残疾证。
咨询残疾人联合会：
- 携带有效身份证件和残疾证到当地的残疾人联合会进行咨询。
- 残联作为管理残疾人事务的官方机构，通常能够查询并告知您该公司是否使用了您的残疾证进行相关登记或申请。
税务部门查询（需合理理由与授权）：
- 在合法合规且符合程序的情况下，您可以向当地税务部门咨询，了解公司在税收申报中是否使用了您的残疾证信息。
- 这种查询通常需要您提供合理的理由和必要的授权，以保护公司和个人的隐私。
三、法律途径与申请信息公开
申请信息公开或数据访问：
- 根据您所在地区的法律法规，您有权要求公司公开或提供与个人相关的信息，包括残疾证信息的使用情况。
- 您需要按照法定程序向公司提交书面申请，并附上必要的身份证明和申请材料，以获取这些信息。
寻求法律援助或投诉：
- 如果您发现公司存在违法使用或泄露您的残疾证信息的行为，您应考虑寻求法律援助或向相关部门投诉。
- 您可以咨询专业的律师或法律机构，了解自身权益和可行的法律途径，以维护自己的合法权益。
四、注意事项
- 在整个查询过程中，您必须严格遵守法律法规和相关部门的规定，保护个人隐私和企业的商业秘密。
- 您应时刻注意保护个人隐私和信息安全，避免在不安全的网络环境下讨论敏感信息或泄露个人身份。
- 如果您对查询结果有任何疑虑或担忧，建议及时咨询专业的法律顾问或律师，以获取更具体的建议和指导。
综上所述，发现残疾证是否被公司占用需要您通过合法途径进行查询和确认。希望这些建议能够帮助您维护自己的合法权益。