针对您提出的“残疾证被公司使用了怎么处理”的问题，这确实是一个涉及个人权益保护的重要事项。以下是我为您提供的详细解答和建议：

一、确认事实与收集证据

首先，您需要确认残疾证是否确实被公司不当使用，比如公司是否未经您同意就使用了您的残疾证信息来享受某些政策优惠或减免，或者是否将您的残疾情况作为解雇、降薪等不当行为的理由。在确认事实后，务必收集相关证据，如公司使用残疾证的记录、相关通知或文件、与公司的沟通记录等。

二、了解相关法律法规

根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，用人单位不得因劳动者残疾而实施就业歧视，也不得未经劳动者同意擅自使用其个人信息。如果公司确实存在不当使用残疾证的行为，这可能构成对劳动者权益的侵犯。

三、与公司沟通协商

在收集到足够证据后，您可以尝试与公司进行沟通协商，明确表达您的诉求和关切。要求公司立即停止不当使用残疾证的行为，并给出合理的解释和解决方案。如果公司愿意积极配合并解决问题，那么这可能是最快捷、最有效的解决方式。

四、寻求法律援助或投诉

如果公司拒绝沟通或无法给出满意的解决方案，您可以考虑寻求法律援助或向相关部门投诉。您可以咨询当地劳动监察部门或残疾人联合会，了解具体的投诉流程和所需材料。在投诉时，务必提供详细的证据和情况说明，以便相关部门能够准确了解问题并作出处理。

五、保护个人隐私与权益

在整个过程中，您需要特别注意保护个人隐私和权益。不要随意将残疾证等个人信息泄露给无关人员或机构。同时，也要关注自己的心理健康和情绪状态，避免因处理此事而产生过大的压力或焦虑。

六、参考案例与法官说法

从您提供的参考信息中，我们可以看到类似案例中法院对于用人单位不当使用残疾证或实施就业歧视的行为是持否定态度的。法院认为，残疾人的权利不应停留于基本的社会保障，还应包括平等的就业权利。用人单位应当鼓励帮助残疾人体面地融入工作与生活，而不是将其作为解雇或歧视的理由。

综上所述，如果您的残疾证被公司不当使用，您应该首先确认事实并收集证据，然后与公司沟通协商。如果无法解决问题，可以寻求法律援助或向相关部门投诉。在整个过程中，务必保护好自己的个人隐私和权益。希望这些建议能够对您有所帮助。