工厂老板突发疾病去世，员工可从以下几个方面来保障自己的权益：
工资与经济补偿
- 工资支付：根据《工资支付暂行规定》，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。老板去世并不影响工厂与员工之间劳动关系的本质，工厂作为用人单位的实体依然存在（若工厂为个体工商户，其财产用于清偿债务；若为有限责任公司等，以其公司财产为限承担责任），所以员工有权要求工厂支付至老板去世时已工作期间的工资。如果工厂拒不支付，员工可以向当地劳动监察部门投诉，劳动监察部门会依法进行调查处理，责令工厂支付工资。
- 经济补偿：如果因为老板去世导致工厂无法继续经营而与员工解除劳动合同，根据《劳动合同法》规定，工厂应当向员工支付经济补偿。经济补偿按员工在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向员工支付半个月工资的经济补偿。这里所称月工资是指员工在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
社会保险权益
- 社保缴纳：工厂应当按照法律规定为员工缴纳社会保险。老板去世后，工厂仍需继续履行社保缴纳义务，直至与员工解除劳动关系。如果工厂停缴社保，员工可以向当地社保部门反映情况，社保部门会督促工厂补缴。若工厂确实无力补缴，员工在一定条件下可以申请将社保关系转为灵活就业人员参保或者转入新单位继续参保。
- 社保待遇享受：如果员工符合享受社会保险待遇的条件，如养老保险达到退休年龄且缴费满一定年限、医疗保险在患病时等，即使老板去世，员工依然可以依法享受相应的社保待遇。例如，员工达到法定退休年龄且养老保险缴费满15年，可以办理退休手续并按月领取养老金。
劳动关系处理
- 劳动合同的继续履行或解除：如果工厂能够继续经营，原劳动合同应继续履行，员工继续在原岗位工作，工厂按照原劳动合同约定支付工资、提供劳动条件等。如果工厂因老板去世无法继续经营，工厂应与员工协商解除劳动合同，并按照上述经济补偿的规定给予员工补偿。如果工厂未与员工协商一致单方面解除劳动合同，可能构成违法解除，员工可以要求工厂继续履行劳动合同或者按照经济补偿标准的二倍支付赔偿金。
- 劳动争议解决：如果员工与工厂在工资支付、经济补偿、社保缴纳等方面产生争议，员工可以首先与工厂进行协商解决。协商不成的，可以向当地劳动争议调解组织申请调解，如企业劳动争议调解委员会、基层人民调解组织等。调解不成的，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，对仲裁裁决不服的，还可以向人民法院提起诉讼。
特殊情况处理
- 个体工商户情况：如果工厂是个体工商户，老板去世后，其债务由其个人财产承担。员工可以先与老板的继承人协商解决工资、经济补偿等问题。如果继承人继承了工厂的财产，应当在继承财产范围内承担支付员工工资和经济补偿等义务。如果协商不成，员工可以通过法律途径向老板的继承人主张权利。
- 工厂破产情况：如果工厂因老板去世等原因导致破产，员工的工资、医疗、伤残补助、抚恤费用，所欠的应当划入员工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用，以及法律、行政法规规定应当支付给员工的补偿金等，在破产财产分配中享有优先受偿的权利。员工可以向破产管理人申报债权，参与破产财产分配。