针对您提出的“合作没有协议，但是确实对方参与了，他不认怎么办”这一问题，我的结论是：您可以通过收集其他证据来证明合作事实及对方参与的情况，进而维护自己的权益。 以下是从不同角度为您进行的分析和建议：
一、法律背景与原则
在合同法领域，虽然书面协议是证明合作关系的直接且有力证据，但并非唯一证据。根据《中华人民共和国民法典》及相关法律规定，当事人之间没有书面合同，但一方已经履行主要义务，对方接受的，该合同仍然成立。这意味着，即使没有书面协议，只要您能证明双方存在事实上的合作关系，且对方已经参与了合作并接受了合作成果，那么您的权益仍然受到法律保护。
二、证据收集与证明
沟通记录：
- 收集与对方之间的所有沟通记录，包括但不限于邮件、短信、微信聊天记录、电话录音等。这些记录中可能包含对方承认参与合作、讨论合作细节或接受合作成果的内容。
合作成果：
- 保留合作过程中产生的所有成果，如项目报告、设计图纸、产品样品、销售记录等。这些成果可以作为证明合作事实及对方参与情况的有力证据。
证人证言：
- 寻找了解合作情况的第三方证人，如共同的朋友、合作伙伴或行业专家等。他们的证言可以为您的合作事实提供旁证。
其他间接证据：
- 如合作期间的银行转账记录、发票、收据等，这些证据虽然不能直接证明合作事实，但可以间接证明双方之间存在经济往来，从而辅助证明合作关系。
三、法律建议与行动
尝试协商：
- 在收集到一定证据后，您可以尝试与对方进行协商，明确表达您的立场和诉求，并出示相关证据以支持您的观点。通过协商，您可能能够达成一个双方都能接受的解决方案。
发送律师函：
- 如果协商无果，您可以考虑委托律师向对方发送律师函。律师函是一种正式的法律文件，可以明确告知对方您的法律诉求和可能采取的法律措施，从而促使对方重新考虑并可能达成和解。
提起诉讼：
- 如果对方仍然拒绝承认合作事实并拒绝履行相关义务，您可以考虑向法院提起诉讼。在诉讼过程中，您需要提交上述收集到的证据以支持您的诉求。法院将根据双方提供的证据和法律规定进行裁决。
四、可能面临的法律后果
- 如果法院最终认定双方存在合作关系且对方确实参与了合作，那么对方可能需要承担相应的法律责任，如支付合作款项、赔偿损失等。
- 如果法院认定双方不存在合作关系或对方未参与合作，那么您可能需要承担举证不能的法律后果，即您的诉求可能无法得到法院的支持。
最后，我建议您在处理此类纠纷时保持冷静和理性，积极收集证据并寻求专业法律帮助。 如果您有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。