核心结论：对于安排好的加班，员工私自多加班的情况，需从公司规章制度、劳动法规定及双方协商三个角度综合处理。以下为具体分析：
公司规章制度层面
公司应首先审查内部规章制度中关于加班的条款。若制度明确规定加班需提前申请并经审批（如《员工手册》或《加班管理制度》），则员工私自多加班的行为属于违反公司规定。公司可依据制度采取相应措施，例如：
- 不认可私自加班部分的工作时长，不支付加班费；
- 对多次违规的员工进行警告、扣减绩效等纪律处分。
依据：根据《劳动合同法》第四条，用人单位依法制定的规章制度，劳动者应当遵守。
劳动法规定层面
即使员工私自加班，公司仍需注意法律风险：
- 加班事实认定：若员工能证明私自加班是因公司工作安排或紧急任务导致（如邮件、聊天记录等），可能被认定为“被动加班”，公司仍需支付加班费。
- 加班时长限制：根据《劳动法》第四十一条，每日加班一般不得超过1小时，特殊情况不超过3小时，每月累计不超过36小时。若私自加班导致超时，公司可能面临劳动监察处罚。
建议：公司应要求员工填写加班申请表，明确加班原因、时长，并由部门负责人审批，以固定证据。
双方协商与预防措施
- 沟通解决：公司可与员工沟通，了解私自加班原因（如工作量过大、效率问题等），针对性调整工作安排或提供培训。
- 优化管理：通过合理分配任务、引入项目管理工具等方式，减少员工因任务积压而私自加班的情况。
- 明确后果：在规章制度中明确私自加班的处理方式（如不支付费用、视为旷工等），并确保员工签署确认。
总结：公司需平衡制度刚性与管理灵活性，既维护自身权益，又避免因处理不当引发劳动争议。如有具体案例或细节需要进一步分析，可直接向我咨询。