结论：员工申请劳动仲裁期间，公司仍需依法为其缴纳社保，这是公司的法定义务，不会因劳动仲裁的申请而免除。

1. 从法律义务角度分析：

   • 根据《中华人民共和国社会保险法》的相关规定，用人单位应当自用工之日起三十日内为其职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记，并按时足额缴纳社会保险费。这一义务是法定的，不因员工是否申请劳动仲裁而改变。
   • 劳动仲裁是员工与用人单位之间因劳动争议而寻求法律救济的一种方式，它并不影响双方之间原有的劳动关系，也不免除用人单位依法应承担的社会保险缴纳义务。

2. 从实际操作角度分析：

   • 在劳动仲裁期间，如果公司停止为员工缴纳社保，员工可以向社会保险经办机构投诉，要求公司补缴。社会保险经办机构有权对公司进行稽查，并责令其补缴社会保险费及滞纳金。
   • 此外，如果公司因未依法缴纳社保而给员工造成损失的，员工还有权要求公司承担赔偿责任。

3. 从风险防范角度分析：

   • 对于公司而言，在劳动仲裁期间继续为员工缴纳社保，是遵守法律法规、维护员工权益的必要举措，也是降低法律风险、避免额外损失的有效方式。
   • 如果公司因未缴纳社保而引发新的劳动争议或法律纠纷，不仅会影响公司的声誉和形象，还可能面临更严重的法律后果。

建议：作为公司，应当严格遵守法律法规，按时足额为员工缴纳社会保险费，即使在劳动仲裁期间也不例外。如果员工对社保缴纳有疑问或争议，公司应当积极与员工沟通协商，寻求妥善解决方案。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。