结论：工伤养伤期间被算作旷工是不合法的，你可以通过以下方式维护自身权益：

1. 明确工伤认定与停工留薪期的法律规定
   根据《工伤保险条例》及《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，职工因工作遭受事故伤害或患职业病需要暂停工作接受治疗的，属于停工留薪期。在此期间，用人单位应按原工资福利待遇支付工资，且不得以旷工为由解除劳动合同或扣减工资。若单位未申请工伤认定，你可在受伤后1年内自行向社保部门申请，确认工伤后即可享受停工留薪期待遇。

2. 收集证据证明工伤事实与养伤必要性
   若单位质疑你“旷工”，需重点收集以下证据：

   • 工伤认定材料：如事故现场照片、同事证言、医院诊断证明、病历等，证明受伤与工作相关；
     
   • 医疗证明：医生出具的病假建议书、休假证明，明确需暂停工作的具体期限；
     
   • 沟通记录：与单位人事或领导沟通养伤事宜的聊天记录、邮件等，证明你已履行告知义务。
     这些证据可证明你未到岗是因工伤治疗需要，而非主观旷工。

3. 与单位协商或通过法律途径解决

   • 协商：向单位说明法律规定，要求其纠正错误认定，补发停工留薪期工资，并出具书面证明恢复考勤记录；
     
   • 投诉：若协商无果，可向当地劳动监察大队投诉，要求单位整改；
     
   • 仲裁/诉讼：若单位仍坚持扣减工资或以旷工为由解除合同，可申请劳动仲裁，主张违法解除赔偿金（2N）或恢复劳动关系，并要求补发工资。仲裁时效为1年，需尽快行动。

关键提醒：停工留薪期一般不超过12个月，伤情严重或情况特殊的可延长，但需经劳动能力鉴定委员会确认。若单位未依法支付待遇，除补发工资外，还可能面临行政处罚。建议优先通过书面形式（如邮件、短信）与单位沟通，保留证据，以便后续维权。