职务侵占达到5000元，公安机关通常不会作为刑事案件受理，因为这一金额未达到职务侵占罪的刑事立案标准。以下是对此问题的详细分析：
一、法律定性
根据《中华人民共和国刑法》第二百七十一条的规定，公司、企业或者其他单位的人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的，才构成职务侵占罪。而“数额较大”的具体标准，通常由各地司法解释确定。以多数地区为例，职务侵占罪的“数额较大”起点一般为3万元或更高（如北京市为1万元）。因此，5000元的侵占金额在多数地区尚未达到刑事立案标准。
二、处理方式
不构成犯罪：
- 由于金额未达立案标准，行为人通常不会被追究刑事责任。
可能面临的行政处罚：
- 治安管理处罚：虽然职务侵占与盗窃性质不同，但实际执法中，对于金额较小、情节轻微的职务侵占行为，公安机关可能参照《中华人民共和国治安管理处罚法》第四十九条的规定，对行为人进行治安管理处罚，如处以拘留或罚款。不过，这种处理方式并非普遍适用，需根据具体情况判断。
- 单位内部处分：用人单位可依据内部规章制度，对行为人给予警告、记过、开除等纪律处分。
民事责任：
- 返还财产：行为人需退还侵占的5000元及可能产生的孳息（如利息）。
- 赔偿损失：若侵占行为导致单位其他经济损失（如追讨费用、业务损失等），行为人需承担相应的赔偿责任。
三、建议措施
主动退赔：
- 行为人应尽快归还侵占的款项，以减轻或避免可能的法律后果。
协商和解：
- 与单位进行沟通，尝试达成书面协议，明确退赔金额和方式，避免纠纷升级。
法律咨询：
- 在面临法律问题时，及时向我咨询，了解自身权利和义务，制定合适的应对策略。
完善制度：
- 对于单位而言，应加强内部控制和财务监管，定期开展合规培训，从源头上减少职务侵占行为的发生。
四、典型案例参考
- 案例一：某公司员工侵占公款5000元，因金额未达刑事立案标准，被公安机关处以行政拘留（或未受处罚），同时被单位解除劳动合同。
- 案例二：另一员工侵占6000元（超过当地立案标准），被判处有期徒刑6个月，缓刑1年，并处罚金5000元。
总结：职务侵占达到5000元，公安机关通常不会作为刑事案件受理。但行为人仍可能面临行政处罚或民事赔偿等法律后果。因此，建议行为人主动退赔、协商和解，并咨询专业律师以了解自身权利和义务。同时，单位也应加强内部控制和财务监管，以预防职务侵占行为的发生。如有任何法律问题，请直接向我咨询。