核心结论：合同未收到款但发票已开具的情况下，您需要结合合同条款、交易习惯及法律规定，采取分步骤的应对措施，包括与对方沟通、发送书面催款通知、评估合同履行情况，必要时通过法律途径解决，同时注意防范税务风险。以下是具体分析：

1. 优先与对方沟通，明确未付款原因

• 沟通目的：首先通过电话、邮件或书面函件与对方联系，了解未付款的具体原因（如资金周转问题、对合同履行有异议等）。这是最直接且成本最低的解决方式。
• 沟通要点：
  • 确认对方是否认可债务存在；
  • 要求对方明确付款时间节点；
  • 保留沟通记录（如邮件、微信聊天记录等），作为后续证据。

2. 发送书面催款通知，固定债权证据

• 法律依据：根据《民法典》第577条，当事人一方不履行合同义务的，应当承担继续履行、采取补救措施或赔偿损失等违约责任。
• 操作建议：
  • 起草《催款函》，明确欠款金额、合同依据、发票开具情况及付款期限；
  • 通过EMS（留存邮寄凭证）或电子邮件（使用可追溯的正式邮箱）发送，确保对方签收；
  • 若对方仍不回应，可考虑委托律师发送《律师函》，增加威慑力。

3. 评估合同履行情况，决定是否暂停服务或供货

• 风险点：若您已履行合同义务（如交付货物或提供服务），但对方未付款，您有权依据《民法典》第527条行使“不安抗辩权”，暂停后续履行并要求对方提供担保。
• 操作建议：
  • 检查合同中是否约定“先付款后开票”或“分期付款”条款；
  • 若对方存在明显丧失履约能力的情形（如经营恶化、涉诉），可书面通知对方暂停履行，并要求其限期付款或提供担保。

4. 考虑法律途径解决，包括诉讼或仲裁

• 适用情形：若沟通、催款均无效，且对方无合理抗辩理由，可向法院起诉或依据合同约定申请仲裁。
• 关键证据：
  • 合同文本（证明双方权利义务）；
  • 发票及交付凭证（证明您已履行开票义务）；
  • 催款记录（证明您已积极主张权利）；
  • 对方认可欠款的证据（如回复邮件、录音等）。
• 注意事项：
  • 诉讼时效为3年，自知道权利受损之日起计算；
  • 若合同约定了违约金或利息，可一并主张。

5. 防范税务风险，避免“虚开发票”嫌疑

• 风险点：根据《发票管理办法》，开具发票后未收款可能被税务机关认定为“虚开发票”（若无法证明交易真实性）。
• 应对措施：
  • 保留合同、物流单据、验收单等证明交易真实性的材料；
  • 若长期未收款，可向税务机关说明情况，或考虑红冲发票（需对方配合）；
  • 避免为“走账”等非法目的开具与实际交易不符的发票。

6. 后续合同条款优化建议

• 预防措施：为避免类似情况再次发生，建议在合同中明确：
  • 付款与开票的先后顺序（如“先收款后开票”）；
  • 逾期付款的违约金标准（如日万分之五）；
  • 争议解决方式（如仲裁或诉讼管辖地）。

总结：合同未收款但已开票时，您应优先通过沟通、催款固定证据，评估对方履约能力后决定是否暂停履行，必要时通过法律途径维权，同时注意税务合规。若需进一步分析具体合同条款或起草法律文书，可随时向我咨询。