在商业交易中，按照合同规定先开票但未收款的情况确实可能带来一些风险和问题，特别是税务和法律方面的风险。为了妥善处理这种情况，您可以采取以下策略：
一、明确合同条款
在签订合同时，应确保财务部门明确规定开具的发票不作为收款证明。这样，在后期如果款项无法收回，您可以在法律上有更多的依据来维护自己的权益。
二、采取预防措施
让对方出具收条：在开具发票时，您可以要求对方出具收到发票的收条，并在收条上特别注明“款项未收到”。这样做可以为您提供一个明确的证据，证明在开具发票时款项尚未支付。
在发票上标注：如果可能的话，您也可以在发票背面写上“给付发票时款项尚未支付”并由对方签字确认。这样，发票本身就成为了款项未付的证据。
三、加强后续管理
建立应收账款台账：对于先开票后收款的情况，应建立详细的应收账款台账，记录发票开具日期、金额、对方单位以及预计收款日期等信息。这样可以帮助您更好地跟踪和管理应收账款。
定期催收款项：根据台账记录，定期与对方单位联系催收款项。如果款项长期未付，应及时采取法律手段维护自己的权益。
四、关注税务处理
由于先开票后收款可能涉及税务风险，您应密切关注相关的税务处理。如果款项最终无法收回，您可能需要向税务机关申请退税或进行其他税务调整。因此，在处理这种情况时，建议您咨询专业的税务顾问或会计师以确保合规性。
综上所述，按照合同规定先开票但未收款的情况需要您采取一系列措施来妥善处理。通过明确合同条款、采取预防措施、加强后续管理以及关注税务处理等方面的工作，您可以有效地降低风险并维护自己的合法权益。