结论：在单位不承认劳动关系且只有复印件的情况下，劳动者仍可通过多种途径证明劳动关系存在，进而维护自身权益。以下从不同角度为你详细分析：
一、复印件的证明力及补充证据收集
复印件的证明力：
- 复印件本身并非无效证据，但其证明力相对较弱。在劳动争议中，若单位对复印件的真实性提出异议，劳动者需提供其他证据予以佐证，以形成完整的证据链。
补充证据收集：
- 工资支付记录：如银行转账记录、工资条等，这些记录能直接证明单位向劳动者支付了工资，是劳动关系存在的重要证据。
- 工作证、服务证等：这些证件上通常印有单位名称和劳动者姓名，能证明劳动者在单位工作的事实。
- 考勤记录：如打卡记录、考勤表等，能证明劳动者在单位的工作时间和出勤情况。
- 同事证言：同事的证言也能作为证明劳动关系存在的辅助证据，尤其是当同事愿意出庭作证时。
- 其他证据：如工作邮件、聊天记录、工作照片等，这些证据虽不如前述证据直接，但也能在一定程度上证明劳动关系。
二、申请劳动仲裁及举证责任
申请劳动仲裁：
- 若单位不承认劳动关系，劳动者可向当地劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，要求确认劳动关系。
举证责任：
- 在劳动仲裁过程中，劳动者需承担初步的举证责任，即提供能证明劳动关系存在的证据。若劳动者提供的证据足以形成初步的证据链，举证责任将转移至单位，单位需提供反驳证据。
- 若单位无法提供反驳证据或反驳证据不足以推翻劳动者提供的证据，劳动争议仲裁委员会将认定劳动关系存在。
三、法律后果及维权建议
法律后果：
- 若劳动关系被确认存在，单位需承担相应的法律责任，如支付未签订劳动合同的双倍工资、补缴社会保险等。
- 若单位拒绝履行相关义务，劳动者可向法院申请强制执行。
维权建议：
- 及时收集证据：劳动者在发现单位不承认劳动关系时，应尽快收集相关证据，以免证据灭失或难以收集。
- 咨询专业律师：在劳动仲裁或诉讼过程中，劳动者可咨询专业律师，以获取更专业的法律建议和帮助。
- 保持冷静和理性：在维权过程中，劳动者应保持冷静和理性，避免与单位发生不必要的冲突和纠纷。
四、特殊情况处理
- 若复印件被单位否认且无其他直接证据：
- 在这种情况下，劳动者可尝试通过其他途径证明劳动关系，如申请劳动保障监察部门介入调查、寻求工会组织帮助等。
- 若仍无法证明劳动关系，劳动者可考虑通过其他法律途径维护自身权益，如提起民事诉讼要求单位承担侵权责任（需满足侵权责任构成要件）。
总结与建议：在单位不承认劳动关系且只有复印件的情况下，劳动者应积极收集其他证据以佐证复印件的真实性，并及时申请劳动仲裁以确认劳动关系。在维权过程中，劳动者可咨询专业律师以获取更专业的法律建议和帮助。若你面临此类问题，可直接向我咨询，我将根据你的具体情况为你提供更详细的法律指导。