单位不承认劳动关系时，您确实可以向法院起诉，但在此之前，通常建议先通过劳动仲裁确认劳动关系，这是更直接且高效的解决途径。以下是对此问题的详细分析：
一、法律途径选择
劳动仲裁优先：
- 根据《劳动争议调解仲裁法》的规定，劳动争议案件一般应先向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。确认劳动关系属于劳动争议范畴，因此，您首先应当向当地的劳动争议仲裁委员会提起仲裁申请，要求确认您与单位之间存在劳动关系。
- 劳动仲裁具有程序简便、周期短、成本低等优点，是解决劳动争议的首选方式。
法院诉讼作为后续手段：
- 如果劳动仲裁委员会裁决不支持您的请求，或者单位在仲裁裁决后不履行裁决义务，您可以在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。
- 法院诉讼是最终的解决途径，具有强制执行力，但程序相对复杂，周期较长，成本也较高。
二、证据收集与准备
- 无论选择劳动仲裁还是法院诉讼，您都需要提供充分的证据来证明您与单位之间存在劳动关系。这些证据可以包括但不限于：
- 劳动合同：直接证明您与单位之间的劳动关系。
- 工资单、银行转账记录：证明单位向您支付工资的情况。
- 工作证、工作服、考勤记录：证明您在单位工作的事实。
- 同事证言、工作记录、邮件往来等：辅助证明您与单位之间的劳动关系。
三、法律建议
及时申请劳动仲裁：
- 一旦发现单位不承认劳动关系，应尽快向劳动争议仲裁委员会提起仲裁申请，以免错过仲裁时效。
充分准备证据：
- 在申请仲裁或提起诉讼前，务必收集并整理好所有能够证明劳动关系的证据，确保在仲裁或诉讼过程中能够有力地支持您的主张。
寻求专业法律帮助：
- 劳动争议案件涉及复杂的法律程序和专业知识，建议您在处理过程中寻求专业律师的帮助，以确保您的权益得到充分保障。
四、可能后果
- 如果仲裁或诉讼成功：法院或仲裁委员会将确认您与单位之间存在劳动关系，单位将需要承担相应的法律责任，如支付工资、缴纳社会保险等。
- 如果仲裁或诉讼失败：您可能需要考虑其他途径来维护自己的权益，如与单位协商、向劳动监察部门投诉等。但请注意，这些途径可能无法直接解决劳动关系确认的问题。
综上所述，单位不承认劳动关系时，您可以通过劳动仲裁或法院诉讼来维护自己的权益。但在此之前，请务必收集好充分的证据，并考虑寻求专业律师的帮助。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。