结论：幼师在合同期内辞职被扣两个月工资是否合法，需根据具体情况判断，一般情况下不合法，但若因辞职给用人单位造成重大损失且合同有明确约定，可能部分合法。以下从不同角度详细分析：

1. 一般情况下的不合法性

根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。在试用期内提前三日通知用人单位，也可以解除劳动合同。这意味着，劳动者在履行了法定通知义务后，有权解除劳动合同，用人单位不得无故克扣工资。

工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，用人单位无权随意扣除。如果幼师已经按照法律规定提前通知了用人单位，并且没有违反合同中的其他约定（如竞业限制、保密义务等），那么用人单位扣除两个月工资的行为很可能是违法的。

2. 特殊情况下的部分合法性

尽管一般情况下用人单位不得克扣工资，但如果幼师的辞职行为给用人单位造成了重大损失，并且劳动合同中有明确约定因辞职造成损失需赔偿的条款，那么用人单位可能有权要求幼师赔偿部分损失。但这种赔偿通常应限于实际损失，并且需要用人单位提供充分的证据证明损失的存在和金额。

• 实际损失：用人单位需要证明幼师的辞职行为直接导致了哪些具体损失，如招聘新员工的费用、培训费用、因幼师离职导致的业务中断损失等。
• 合同约定：劳动合同中必须有明确的条款约定，因辞职造成损失需赔偿，并且该条款不得违反法律法规的强制性规定。
• 赔偿限额：即使合同有约定，赔偿金额也应合理，不得过高。一般来说，赔偿金额不应超过幼师一个月的工资，除非用人单位能证明损失确实巨大且超出这一范围。

3. 法律建议

• 幼师方面：如果认为用人单位扣除工资的行为不合法，可以先与用人单位协商解决。如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
• 用人单位方面：如果确实因幼师辞职造成了损失，并且希望要求赔偿，应确保合同中有明确约定，并且能够提供充分的证据证明损失的存在和金额。同时，赔偿金额应合理，不得过高。

4. 可能的法律后果

• 如果用人单位违法扣除工资：幼师有权要求用人单位支付被扣除的工资，并可能要求用人单位支付经济补偿金或赔偿金。
• 如果幼师需赔偿损失：如果劳动合同中有明确约定且用人单位能提供充分证据，幼师可能需要按照合同约定赔偿部分损失。但赔偿金额应合理，不得过高。

总结：幼师在合同期内辞职被扣两个月工资是否合法，需根据具体情况判断。一般情况下不合法，但若因辞职给用人单位造成重大损失且合同有明确约定，可能部分合法。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。