结论：卖掉乡镇自建房两年后，即使没有房产证且签了合同按了手印，能否要回房屋并非绝对，需根据具体情况判断，主要包括合同效力、买方是否支付房款及房屋是否已交付使用等因素。

分析如下：

1. 合同效力问题：

   • 根据《民法典》的相关规定，合同的有效性取决于其是否满足法律规定的生效要件，包括当事人具有相应的民事行为能力、意思表示真实、不违反法律或行政法规的强制性规定等。
   • 对于乡镇自建房，若因未取得房产证而无法办理过户手续，这并不直接导致买卖合同无效。合同本身可能仍然有效，只是无法履行过户这一特定义务。
   • 若合同被认定为无效：根据《民法典》第一百五十七条，因无效合同取得的财产应当予以返还。因此，在这种情况下，您有可能要回房屋。但需注意，若买方已支付合理对价且房屋已交付使用，买方可能主张善意取得，从而拒绝返还。

2. 买方是否支付房款及房屋是否已交付使用：

   • 若买方已支付全部或部分房款，且房屋已交付买方使用，这增加了买方对房屋的占有和使用权益。
   • 在此情况下，即使合同因某种原因被认定为无效或可撤销，您要回房屋也可能面临法律上的障碍，因为买方可能已基于合同取得了对房屋的合法占有。

3. 法律程序与证据收集：

   • 若您希望要回房屋，可能需要通过法律途径解决，如提起诉讼或申请仲裁。
   • 在此过程中，您需要收集并提交相关证据，如买卖合同、付款凭证、房屋交付证明等，以支持您的主张。
   • 同时，您也需要准备应对买方可能提出的抗辩，如合同有效、已支付房款、房屋已交付使用等。

4. 特殊情况考虑：

   • 若乡镇自建房因政策原因无法办理房产证，且该政策在买卖合同签订后仍未改变，这可能影响合同的履行和房屋的返还。
   • 另外，若买方在购买房屋时已知或应知房屋无法办理房产证，这可能影响其主张善意取得的权利。

建议：

• 咨询专业律师：鉴于此类案件涉及复杂的法律问题和证据收集，建议您直接向我咨询，以便更详细地了解您的具体情况和法律权益。
• 收集证据：在咨询律师的同时，开始收集与房屋买卖相关的所有证据，包括合同、付款凭证、房屋交付证明等。
• 考虑和解或调解：在提起诉讼或申请仲裁前，您可以考虑与买方进行和解或调解，以达成双方都能接受的解决方案。

最后，每个案件都有其独特性，因此上述分析仅供参考。在处理此类问题时，请务必根据您的具体情况和当地法律法规进行决策。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。