工资超过5000元通过微信发放，对员工本身而言，通常不会产生直接的负面影响，但可能存在一些潜在的风险和需要注意的点。以下从几个方面详细分析：

1. 工资发放的合法性与合规性：

   • 无论工资是通过银行转账还是微信等第三方支付平台发放，只要确保工资足额、按时发放，且符合劳动合同及国家相关法律法规的规定，就是合法的。
   • 微信发放工资本身并不违法，但关键在于是否能够确保工资的准确记录和可追溯性。银行转账通常有更完善的交易记录和凭证，而微信转账虽然也有记录，但在某些情况下可能不如银行转账那样正式和易于管理。

2. 税务处理：

   • 工资收入属于个人所得税的征税范围。无论工资通过何种方式发放，员工都有义务按照国家规定缴纳个人所得税。
   • 微信发放工资时，员工应确保自己能够准确记录工资收入，并在年度汇算清缴时正确申报和缴纳税款。如果因为微信转账的记录不够清晰或完整而导致税务问题，员工可能需要承担相应的责任。

3. 劳动权益保障：

   • 工资是员工劳动权益的重要组成部分。无论工资发放方式如何，员工都有权要求用人单位提供清晰的工资条或工资记录，以确认自己的工资收入情况。
   • 如果微信发放工资导致工资记录不清晰或存在争议，员工在维护自己劳动权益时可能会面临一些困难。例如，在申请劳动仲裁或提起诉讼时，可能需要提供更充分的证据来证明自己的工资收入情况。

4. 实际操作中的建议：

   • 保留转账记录：员工应妥善保存微信转账记录，包括转账时间、金额、对方账号等信息，以备不时之需。
   • 要求用人单位提供工资条：即使工资通过微信发放，员工也有权要求用人单位提供书面或电子形式的工资条，以确认自己的工资收入情况。
   • 关注税务问题：员工应关注自己的个人所得税缴纳情况，确保按时、足额缴纳税款，避免因税务问题而引发不必要的麻烦。

总结来说，工资超过5000元通过微信发放本身对员工没有直接的负面影响，但员工需要关注工资发放的合法性、税务处理、劳动权益保障以及实际操作中的建议等方面。如果有任何疑问或担忧，建议直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。