法定节假日加班工资的追溯期限，主要取决于劳动者主张权利的方式以及具体的法律规定，一般情况下可以追溯两年，但在特定条件下可能更长。以下是对这一问题的详细分析：
一、追溯期限的基本规定
劳动争议仲裁时效：
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
- 但是，对于劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受上述一年仲裁时效期间的限制；但是，劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。
加班工资的性质：
- 加班工资属于劳动报酬的一部分。因此，如果劳动者在劳动关系存续期间主张法定节假日的加班工资，理论上可以不受一年仲裁时效的限制。
- 然而，在实际操作中，由于加班工资的支付通常与具体的考勤记录、工资单等证据相关联，这些证据的保存期限可能有限，因此劳动者仍需及时主张权利。
二、追溯期限的延长情况
用人单位明确表示拒绝支付：
- 如果用人单位明确表示拒绝支付加班工资，或者通过行为表明不会支付（如长期拖欠、未计入工资单等），则仲裁时效可能从劳动者知道或应当知道权利被侵害之日起计算，即可能超过一年。
- 但这种情况下，劳动者仍需尽快采取行动，以避免因证据灭失或用人单位破产等原因导致无法追回加班工资。
特殊情况下的追溯：
- 在某些特殊情况下，如劳动者因不可抗力或其他正当理由无法及时主张权利，仲裁时效可能会中止或中断。
- 此外，如果劳动者能够证明用人单位存在恶意拖欠、隐匿或销毁证据等行为，也可能影响仲裁时效的计算。
三、实际操作中的建议
及时主张权利：
- 劳动者在发现用人单位未支付法定节假日加班工资时，应尽快与用人单位协商解决。
- 如果协商无果，应及时向劳动监察部门投诉或申请劳动争议仲裁，以避免超过仲裁时效。
保留相关证据：
- 劳动者应妥善保存与加班工资相关的证据，如考勤记录、工资单、加班通知等。
- 这些证据在主张权利时至关重要，能够帮助劳动者证明加班事实及用人单位未支付加班工资的情况。
寻求法律帮助：
- 如果劳动者对法律程序不熟悉或担心自己的权益无法得到保障，可以寻求专业律师的帮助。
- 律师能够提供专业的法律意见和指导，帮助劳动者更好地维护自己的合法权益。
举例说明：假设劳动者在2022年法定节假日加班，但用人单位未支付加班工资。如果劳动者在2023年发现这一问题并立即主张权利，那么其主张通常不会受到仲裁时效的限制（因为仍在劳动关系存续期间）。但如果劳动者直到2025年才主张权利，且此时劳动关系已经终止超过一年，那么其主张可能会受到仲裁时效的限制。不过，如果劳动者能够证明用人单位存在恶意拖欠等行为，或者存在其他特殊情况导致仲裁时效中止或中断，那么其主张仍有可能得到支持。
总结来说，法定节假日加班工资的追溯期限并非固定不变，而是受到多种因素的影响。因此，劳动者在发现用人单位未支付加班工资时，应尽快采取行动并保留相关证据，以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。