结论：一般情况下，每周休息一天且一周超过40小时的部分，在标准工时制下，确实算作休息日加班，用人单位需依法支付加班费。但具体还需根据工作合同、公司规定以及所实行的工时制度来判断。

详细分析：

1. 标准工时制：

   • 定义：标准工时制是指劳动者每日工作8小时，每周工作40小时的工时制度。
   • 加班认定：在标准工时制下，如果劳动者每周工作时间累计超过40小时，那么超出部分即视为加班时间。例如，如果劳动者每周工作6天，每天工作8小时，那么每周总工作时间为48小时，超出40小时的部分即为8小时加班时间。
   • 加班费支付：对于这8小时的加班时间，用人单位需按照不低于工资的百分之一百五十的标准支付加班费。

2. 综合计算工时工作制：

   • 适用条件：这种工时制适用于因工作性质特殊，需连续作业或受季节及自然条件限制的企业，且需经劳动行政部门审批。
   • 加班认定：虽然某一具体日（或周）的实际工作时间可以超过8小时（或40小时），但综合计算周期内的总实际工作时间不应超过总法定标准工作时间。如果超出，超出部分应视为延长工作时间，即加班。
   • 加班费支付：对于加班时间，用人单位同样需按照不低于工资的百分之一百五十的标准支付加班费。但需要注意的是，在综合计算工时工作制下，加班费的计算可能涉及更复杂的周期计算。

3. 不定时工作制：

   • 适用对象：主要适用于企业中的高级管理人员、外勤人员、推销人员等因工作无法按标准工作时间衡量的职工，也需经劳动行政部门审批。
   • 加班认定：在不定时工作制下，一般不存在加班的说法，因为该工时制度是针对无法按标准工作时间衡量或需要机动作业的职工而设计的。
   • 特殊情况：然而，有些地区可能规定在法定节假日工作的，即使是不定时工作制的员工，用人单位也应支付加班工资。具体支付标准可能因地区而异，但通常不会低于工资的百分之三百。

4. 工作合同与公司规定：

   • 除了上述工时制度外，劳动者的工作合同和公司规定也是判断加班的重要依据。工作合同中可能会明确约定工作时间、加班计算方式及加班费支付标准等条款。
   • 因此，劳动者在入职前应仔细阅读工作合同，了解自己的权益和义务。同时，公司规定也可能对加班有具体的规定和操作流程，劳动者应遵守公司规定，并在遇到加班问题时及时与公司沟通协商。

建议：

• 如果您对加班时间或加班费有疑问，建议首先查阅您的工作合同和公司规定，了解具体的加班计算方式和加班费支付标准。
• 如果您认为用人单位未依法支付加班费或存在其他违法行为，您可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
• 在任何情况下，都请保留好相关证据，如工作记录、加班通知、工资单等，以便在需要时维护自己的合法权益。

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