结论：员工离职后违反竞业协议，是否可以协商只赔违约金的一半，这并非一个绝对可以或不可以的问题，而是取决于双方协商的结果以及具体情况。不过，从法律角度和实际操作层面，我可以为你详细分析这个问题。
法律角度分析：
竞业协议的法律效力：竞业协议是用人单位与劳动者之间就劳动者离职后一定期限内不得从事与用人单位相竞争的业务或到与用人单位有竞争关系的单位任职所达成的协议。只要竞业协议的内容合法、双方意思表示真实，且不违反法律法规的强制性规定，该协议就具有法律效力。
违约金的约定：竞业协议中通常会约定违约金，这是对劳动者违反竞业限制义务的一种经济制裁。违约金的数额应当合理，既能够体现对用人单位损失的补偿，又不会过分加重劳动者的负担。
协商的可能性：虽然竞业协议具有法律效力，但双方仍然可以在平等、自愿的基础上进行协商。如果劳动者认为违约金过高，或者用人单位出于某种考虑愿意减轻劳动者的负担，双方可以就违约金的数额进行协商，并达成一致意见。
实际操作层面分析：
协商的前提：协商的前提是双方都有意愿进行妥协和让步。如果用人单位坚持要求劳动者支付全额违约金，而劳动者又无力支付或认为违约金过高，那么协商可能难以达成。
协商的结果：即使双方愿意协商，协商的结果也取决于多种因素，如劳动者的经济状况、用人单位的损失情况、双方的关系等。如果协商成功，双方可以签订书面协议，明确违约金的数额和支付方式。
协商不成的后果：如果协商不成，用人单位仍然有权要求劳动者按照竞业协议的约定支付全额违约金。如果劳动者拒绝支付，用人单位可以通过法律途径追究劳动者的责任。
建议：
对于劳动者：如果你认为违约金过高，可以尝试与用人单位进行协商。在协商过程中，你可以提供自己的经济状况证明，或者说明违约金过高对你造成的负担。同时，你也可以咨询专业律师的意见，了解自己的权利和义务。
对于用人单位：如果你认为劳动者违反了竞业协议，且违约金数额合理，你可以要求劳动者支付全额违约金。如果劳动者提出协商，你可以根据实际情况考虑是否接受。在协商过程中，你可以要求劳动者提供经济状况证明，或者要求劳动者提供其他担保措施。
总之，员工离职后违反竞业协议是否可以协商只赔违约金的一半，这取决于双方协商的结果以及具体情况。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。