超市员工不佩戴健康证是违法的。以下从多个角度为你详细分析：
法律背景与规定
根据《中华人民共和国食品安全法》第四十五条的规定，食品生产经营者应当建立并执行从业人员健康管理制度。患有国务院卫生行政部门规定的有碍食品安全疾病的人员，不得从事接触直接入口食品的工作。从事接触直接入口食品工作的食品生产经营人员应当每年进行健康检查，取得健康证明后方可上岗工作。超市作为食品销售的重要场所，其员工若从事接触直接入口食品的工作，必须佩戴健康证，这是法律对食品生产经营者的明确要求。
违法后果
行政处罚：如果超市员工未佩戴健康证上岗，超市作为食品生产经营者可能会面临行政处罚。根据《中华人民共和国食品安全法》第一百二十六条的规定，食品生产经营者未按规定建立并执行从业人员健康管理制度，或者未按规定组织从业人员进行健康检查的，由县级以上人民政府食品安全监督管理部门责令改正，给予警告；拒不改正的，处五千元以上五万元以下罚款；情节严重的，责令停产停业，直至吊销许可证。
消费者权益受损：员工未佩戴健康证上岗，可能增加食品被污染的风险，从而损害消费者的健康权益。如果消费者因食用超市销售的食品而患病，超市可能需要承担相应的民事赔偿责任。
特殊情况与建议
非接触直接入口食品的工作：如果超市员工从事的是非接触直接入口食品的工作，如收银员、理货员等，虽然法律没有明确要求必须佩戴健康证，但超市为了保障食品安全和消费者健康，也可以要求员工进行健康检查并佩戴健康证。
健康证的有效期与更新：即使员工已经取得了健康证，也需要注意健康证的有效期。健康证通常有一定的有效期，过期后需要重新进行健康检查并更新健康证。超市应建立完善的健康证管理制度，确保员工的健康证始终有效。
加强培训与监督：超市应加强对员工的食品安全培训，提高员工的食品安全意识。同时，超市应建立监督机制，定期检查员工的健康证佩戴情况，确保员工始终符合法律要求。
总结与建议：超市员工不佩戴健康证是违法的，超市作为食品生产经营者应严格遵守相关法律法规，确保员工佩戴健康证上岗。如果超市员工未佩戴健康证，超市可能面临行政处罚和民事赔偿责任。因此，我建议超市加强健康证管理，确保员工的健康证始终有效，并加强对员工的食品安全培训，提高员工的食品安全意识。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。