若专利侵权纠纷调解协议一方不执行，另一方应当就本纠纷直接向法院起诉。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、起诉的法律依据
根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，当调解协议达成后，若一方不履行，另一方有权向人民法院提起诉讼，要求对方履行调解协议或承担相应的违约责任。在专利侵权纠纷中，若双方已达成调解协议但一方未执行，另一方自然可以依据此法律规定，向法院提起诉讼。
二、起诉的对象和内容
- 起诉对象：应当是未履行调解协议的一方。
- 起诉内容：
- 要求履行调解协议：若调解协议中明确规定了对方的履行义务，如停止侵权行为、赔偿损失等，另一方可以要求法院判决对方履行这些义务。
- 要求承担违约责任：若调解协议中规定了违约责任，如违约金、赔偿损失等，另一方可以要求法院判决对方承担这些违约责任。
三、起诉的流程和注意事项
- 准备起诉材料：包括起诉状、调解协议、证据材料等。起诉状应明确列明原告、被告的基本信息，诉讼请求，事实与理由等。
- 选择管辖法院：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的规定，一般应向被告住所地或侵权行为地的人民法院提起诉讼。
- 提交起诉材料并缴纳诉讼费：将准备好的起诉材料提交给法院，并按照规定缴纳诉讼费。
- 参与诉讼过程：包括庭审、举证、质证等环节，积极维护自己的合法权益。
注意事项：
- 在起诉前，应确保调解协议的有效性，即调解协议是否经过合法程序达成，是否双方真实意思表示等。
- 在起诉过程中，应充分准备证据材料，以证明对方未履行调解协议的事实。
- 应注意诉讼时效的问题，确保在法定的诉讼时效期间内提起诉讼。
四、可能的法律后果
- 若法院判决对方履行调解协议：对方应在判决规定的期限内履行调解协议中的义务，否则可能面临强制执行等法律后果。
- 若法院判决对方承担违约责任：对方应按照判决规定的金额或方式承担违约责任，如支付违约金、赔偿损失等。
五、建议与提醒
- 在达成调解协议前，应充分考虑对方的履约能力和诚信状况，以降低后续执行风险。
- 在调解协议中，可以明确约定违约责任和争议解决方式，以便在对方不履行时能够迅速采取法律措施。
- 若遇到对方不履行调解协议的情况，应及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，并制定合适的诉讼策略。
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