在因调解协议履行发生纠纷后，通常应当就调解协议提起诉讼，而非就原纠纷提起诉讼。以下是对这一问题的详细分析：
一、调解协议的法律效力
调解协议是双方当事人在调解过程中，就争议事项自愿达成的解决方案。一旦调解协议达成并生效，它便具有法律约束力，双方当事人都应当履行。如果一方不履行调解协议，另一方有权依据调解协议向法院提起诉讼，要求对方履行或承担违约责任。
二、就调解协议提起诉讼的优势
- 直接性：就调解协议提起诉讼，可以直接针对调解协议的内容进行审查，判断其是否合法、有效，以及对方是否履行了调解协议中的义务。这种方式更为直接，能够更快地解决纠纷。
- 效率性：由于调解协议已经对原纠纷进行了处理，并达成了解决方案，因此就调解协议提起诉讼可以避免对原纠纷的重复审理，提高诉讼效率。
- 明确性：调解协议通常明确规定了双方的权利和义务，以及违约责任等。因此，在诉讼过程中，法院可以更容易地判断双方的行为是否符合调解协议的规定，从而作出公正的裁决。
三、就原纠纷提起诉讼的局限性
- 重复性：如果就原纠纷提起诉讼，法院可能需要重新审理整个案件，包括事实认定、法律适用等，这会导致诉讼过程的重复和资源的浪费。
- 不确定性：原纠纷可能已经经过了一段时间，相关证据可能已经灭失或难以收集，这会增加诉讼的不确定性。
- 违背调解初衷：调解的初衷是希望双方能够自愿达成解决方案，避免诉讼。如果就原纠纷提起诉讼，可能会违背这一初衷，导致双方关系进一步恶化。
四、特殊情况下的考虑
当然，也存在一些特殊情况，可能需要就原纠纷提起诉讼。例如：
- 调解协议无效或可撤销：如果调解协议存在无效或可撤销的情形（如欺诈、胁迫等），那么双方可以就原纠纷提起诉讼，要求法院重新审理。
- 调解协议未涵盖所有争议事项：如果调解协议只解决了部分争议事项，而双方对其他事项仍存在争议，那么可以就未解决的争议事项提起诉讼。但这种情况下，通常建议先尝试通过补充调解协议等方式解决争议，以避免诉讼。
五、法律建议
- 审查调解协议：在因调解协议履行发生纠纷后，首先应当审查调解协议的内容，判断其是否合法、有效，以及对方是否履行了调解协议中的义务。
- 咨询专业律师：如果对调解协议的法律效力或履行情况存在疑问，建议咨询专业律师，以便获得更准确的法律意见。
- 考虑诉讼策略：在决定是否提起诉讼以及就哪个协议提起诉讼时，应当综合考虑多种因素，包括诉讼成本、诉讼风险、诉讼效率等，以制定最优的诉讼策略。
总之，在因调解协议履行发生纠纷后，通常应当就调解协议提起诉讼。但具体选择哪种方式解决纠纷，还需要根据案件的具体情况和双方的实际情况进行综合考虑。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。