核心结论：对于不打卡员工的年假计算，需结合公司规章制度、劳动合同以及相关法律法规综合判断，具体分以下几种情况说明。

1. 公司有明确规章制度且合法合规
   若公司规章制度中明确规定了年假计算方式（如按实际出勤天数折算、按工作年限固定天数等），且该制度已通过民主程序制定（如职工代表大会讨论、公示等）并告知员工，同时不违反《职工带薪年休假条例》等强制性规定，则以公司制度为准。
   例如：公司规定“年假按实际出勤天数折算，全年应出勤250天，员工实际出勤200天，则年假=5天×(²⁰⁰⁄₂₅₀)=4天”，此类规定合法有效。

2. 公司无明确制度或制度违法
   若公司未制定年假计算规则，或制度内容违法（如完全剥夺不打卡员工的年假权），则需依据《职工带薪年休假条例》计算：

• 年假天数：根据员工累计工作年限确定（1-10年5天、10-20年10天、20年以上15天）；
  
• 未休年假补偿：若公司未安排休假且未支付300%工资报酬，员工可主张权益；
  
• 特殊情况：若员工因个人原因书面放弃年假，公司可免除补偿义务，但需保留书面证据。

1. 不打卡与年假计算的关联性
   不打卡本身不影响年假资格，但可能影响“实际出勤天数”的认定（用于折算年假）。若公司以“未打卡视为缺勤”为由扣减年假，需满足：
   

• 规章制度明确约定“未打卡=缺勤”；
  
• 公司已提供打卡条件（如设备、通知等）；
  
• 员工未打卡无合理理由（如忘打卡但未补签）。
  若公司无法证明上述条件，擅自扣减年假可能构成违法。

建议行动：

1. 优先查阅劳动合同、公司规章制度中关于年假的条款；
   
2. 核对公司计算年假的依据是否合法（如是否按工作年限、是否折算合理）；
   
3. 若公司违法扣减年假，可先协商，协商不成可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
   

如有具体案例或细节需要进一步分析，可直接向我咨询。