结论：在发包人与承包人约定法院管辖，承包人与转承包人约定仲裁，而实际是工人起诉的情况下，确定管辖的方式需根据工人的具体诉求及各方的法律关系来综合判断。以下从不同角度进行分析：

1. 工人起诉发包人或承包人主张工程款

   • 法律关系分析：若工人起诉的是发包人或承包人，且诉求是主张工程款，那么该纠纷本质上仍属于建设工程合同纠纷的一部分。此时，应依据发包人与承包人之间的合同约定来确定管辖。由于发包人与承包人已约定法院管辖，因此，该纠纷应由合同约定的法院进行管辖。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，合同纠纷的管辖通常遵循“原告就被告”或合同约定的原则。在此情况下，由于合同已明确约定管辖法院，故应遵循该约定。

2. 工人起诉承包人或转承包人主张劳务报酬

   • 法律关系分析：若工人起诉的是承包人或转承包人，且诉求是主张劳务报酬，那么该纠纷可能更侧重于劳务合同关系。此时，虽然承包人与转承包人之间约定了仲裁，但这一约定对工人并不具有直接约束力。工人与承包人或转承包人之间的劳务合同关系，应独立于承包人与转承包人之间的建设工程转包合同关系。
   • 管辖确定：对于劳务报酬的纠纷，工人可以选择向有管辖权的法院提起诉讼。若工人选择起诉承包人，且承包人与发包人之间的合同约定对工人无直接约束力，则法院将根据劳务合同关系的实际情况来确定管辖，通常可能是被告住所地或合同履行地法院。若工人选择起诉转承包人，由于转承包人与工人之间并未直接约定仲裁，且该仲裁约定对工人无约束力，因此工人同样可以选择向法院提起诉讼。
   • 特殊情况：如果工人能够证明其与承包人或转承包人之间的劳务合同关系实际上构成了建设工程合同的一部分，且该部分与发包人与承包人之间的合同紧密相关，那么法院在审理时可能会考虑将两部分合同关系合并审理，并依据发包人与承包人之间的合同约定来确定管辖。但这种情况较为特殊，需要具体案件具体分析。

3. 工人起诉多方主体

   • 法律关系分析：若工人同时起诉发包人、承包人及转承包人等多方主体，且诉求涉及工程款及劳务报酬等多个方面，那么该纠纷将更为复杂。此时，法院将需要综合考虑各方的法律关系、合同约定以及工人的实际诉求来确定管辖。
   • 管辖确定：在多方主体被起诉的情况下，法院可能会根据“便于当事人诉讼，便于人民法院审理”的原则，结合各方的合同约定、实际履行地以及工人的诉求等因素来综合确定管辖法院。如果各方之间的合同约定存在冲突或不明确，法院将依据相关法律规定和司法解释来作出判断。

建议：在实际操作中，由于每个案件的具体情况都有所不同，因此建议工人在起诉前咨询专业律师，以便更准确地确定管辖法院或仲裁机构，并制定合适的诉讼策略。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将根据你的具体情况提供详细的法律建议。