公司因工作分配分歧吵架扣除员工年终绩效是否违法，需分情况讨论：
若公司规章制度或劳动合同中明确规定，员工因工作分歧吵架属于严重违反公司纪律或规章制度的行为，且该行为与年终绩效的扣除有直接关联，同时该规章制度或劳动合同条款不违反法律法规的强制性规定，那么公司扣除年终绩效的行为可能不违法。但即便如此，公司也需确保扣除的年终绩效金额合理，且扣除前已给予员工充分的陈述和申辩机会。
若公司规章制度或劳动合同中未明确规定此类情况可以扣除年终绩效，或者扣除年终绩效的条款违反法律法规的强制性规定（如扣除金额过高、未给予员工陈述和申辩机会等），那么公司扣除年终绩效的行为则可能构成违法。根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬，包括年终绩效等福利待遇。公司不得随意扣除员工的劳动报酬，除非有明确的法律依据或合同约定。
进一步分析：
公司规章制度的合法性：公司规章制度是公司内部管理的重要依据，但其制定和执行必须符合法律法规的规定。如果规章制度中的条款与法律法规相抵触，那么这些条款将被视为无效。因此，在判断公司扣除年终绩效是否违法时，首先需要审查公司规章制度的相关条款是否合法。
劳动合同的约定：劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。如果劳动合同中明确约定了员工因工作分歧吵架可以扣除年终绩效，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么公司扣除年终绩效的行为可能具有合法性。但同样，扣除的金额和方式也需合理且合法。
扣除行为的合理性：即使公司规章制度或劳动合同中有相关规定，公司在执行扣除年终绩效的行为时，也需确保扣除的金额合理，且扣除前已给予员工充分的陈述和申辩机会。如果扣除金额过高或未给予员工陈述和申辩机会，那么公司的行为可能构成违法。
建议：
员工角度：如果员工认为公司扣除年终绩效的行为违法，可以首先与公司进行沟通协商，要求公司说明扣除的依据和理由。如果沟通无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
公司角度：公司应确保规章制度的合法性和合理性，避免制定过于苛刻或违法的条款。同时，在执行扣除年终绩效等处罚措施时，应确保扣除的金额合理且程序合法，以避免引发劳动争议和法律风险。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。