结论：绩效扣除与年终奖发放是否违法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、绩效扣除的合法性
劳动合同或规章制度约定：
- 如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了绩效扣除的情形和标准，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司按照约定扣除绩效是合法的。
- 法律依据：根据《工资支付暂行规定（1994年版）》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失，经济损失的赔偿可从劳动者本人的工资中扣除。虽然该条款直接针对的是经济损失赔偿，但绩效扣除若基于合理的工作表现评估，且符合劳动合同或规章制度，亦可视为合法。
扣除比例和最低工资标准：
- 即使劳动合同或规章制度中有绩效扣除的规定，扣除的比例也应合理，且扣除后的工资不得低于当地月最低工资标准。
- 法律依据：同样依据《工资支付暂行规定（1994年版）》第十六条，每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
二、年终奖发放的合法性
劳动合同或规章制度约定：
- 年终奖的发放通常取决于劳动合同或公司规章制度的约定。如果约定了年终奖的发放条件和标准，公司应按照约定执行。
- 分析：若公司因员工绩效不达标而扣除年终奖，需确保该扣除行为符合劳动合同或规章制度的约定，且该约定本身合法合理。
无约定时的处理：
- 如果劳动合同或公司规章制度中没有关于年终奖的明确约定，那么年终奖的发放就属于公司的自主管理范畴。但公司不能随意扣除或取消年终奖，否则可能构成克扣工资或未及时足额支付劳动报酬的违法行为。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。年终奖作为工资的一部分，也应遵循此规定。
三、绩效扣除与年终奖发放的综合考量
合理性审查：
- 公司在扣除绩效或取消年终奖时，应确保行为的合理性。这包括扣除或取消的原因是否充分、程序是否合法、是否对员工进行了充分的告知和解释等。
员工权益保护：
- 员工在面对绩效扣除或年终奖取消时，有权了解自己的权益和公司的行为是否合法。若认为公司的行为不合理或存在争议，员工可以向企业劳动争议调解委员会申请调解，或直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》第七十九条，劳动争议发生后，当事人可以向本单位劳动争议调解委员会申请调解；调解不成，当事人一方要求仲裁的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁裁决不服的，可以向人民法院提起诉讼。
建议：若您面临绩效扣除或年终奖发放的问题，建议首先查阅劳动合同和公司规章制度，了解相关约定。若认为公司的行为不合理或存在争议，可以与公司进行沟通协商，或寻求法律援助以维护自己的合法权益。有问题可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。