年终奖被扣是否合法，这确实是一个涉及劳动者权益的常见问题。对此，我可以从以下几个方面进行详细解答：

结论前置：年终奖被扣的合法性主要取决于劳动合同、员工手册或公司规章制度中的具体约定，以及公司扣发的理由是否合理且符合法律法规。

1. 有明确约定的情况：

   • 如果劳动合同、员工手册或公司规章制度中明确规定了年终奖的发放条件、数额以及扣发情形，并且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司按照约定扣发年终奖是合法的。例如，公司规定员工在年度内出现严重违纪行为时，可以扣发年终奖。若员工确实存在此类行为，公司扣发年终奖则是合理的。

2. 无明确约定或约定不明确的情况：

   • 如果劳动合同、员工手册或公司规章制度中没有关于年终奖的明确约定，或者约定不明确，那么公司通常无权随意扣发年终奖。在这种情况下，年终奖应视为员工应得的劳动报酬的一部分，公司应当全额支付。如果公司无故扣发年终奖，员工有权要求公司补发，并可以通过法律途径维护自己的权益。

3. 特殊情形下的扣发：

   • 在某些特殊情况下，如代扣代缴税款、法院判决或仲裁裁决需从工资中扣款等，公司可以依法扣发相应金额的年终奖。但这些扣发必须有明确的法律依据或合同依据，并且需要遵循相关程序。

4. 恶意克扣的情况：

   • 如果公司为了达到少支付或不支付年终奖的目的，故意设置不合理的考核标准、篡改考核结果或采取其他不正当手段来克扣员工的年终奖，这种行为是违法的。员工有权向劳动仲裁机构申请仲裁或向人民法院提起诉讼，要求公司支付被扣发的年终奖及相应的赔偿。

应对措施：

• 员工在遇到年终奖被扣的情况时，应首先查看劳动合同和公司相关规定，了解自己的权益和公司的义务。
• 若认为公司存在违法行为或不合理扣发年终奖的情况，可以先与公司进行沟通协商，尝试解决问题。
• 若沟通无果，员工可以向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼，维护自己的合法权益。

综上所述，年终奖被扣的合法性需要根据具体情况来判断。员工应充分了解自己的权益和公司的规定，并在必要时采取合适的措施来维护自己的利益。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。