不合法，工资条上注明有社保补贴并不能替代用人单位依法缴纳社保的义务。以下从不同角度进行分析：
法律规定层面：根据《中华人民共和国社会保险法》第五十八条，用人单位应当自用工之日起三十日内为其职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记。未办理社会保险登记的，由社会保险经办机构核定其应当缴纳的社会保险费。这表明，缴纳社保是用人单位的法定义务，不能通过任何形式免除或替代，包括在工资条上注明社保补贴。
社保补贴的性质：社保补贴通常是政府为了鼓励企业吸纳特定群体（如就业困难人员、高校毕业生等）而给予的一种财政补助。这种补贴是政府与企业之间的行为，与员工个人无关，且不能替代企业应为员工缴纳的社保费用。如果企业将社保补贴直接发放给员工，并以此为由不缴纳社保，这是违法的。
工资条的法律效力：工资条是员工工资收入的明细记录，但它并不具有改变法律义务的效力。即使工资条上注明了有社保补贴，这也不能成为用人单位不缴纳社保的合法依据。员工有权要求用人单位按照法律规定缴纳社保，并可以依法维护自己的权益。
员工的权益保护：如果用人单位未依法缴纳社保，员工有权向当地社保部门投诉或举报。社保部门将依法对用人单位进行处罚，并要求其补缴社保费用。同时，员工还可以根据《劳动合同法》的相关规定，要求用人单位支付经济补偿或解除劳动合同。
建议：作为员工，如果发现用人单位在工资条上注明有社保补贴但并未实际缴纳社保，应及时向用人单位提出异议，并要求其依法缴纳社保。如果用人单位拒绝改正，可以向当地社保部门投诉或举报，以维护自己的合法权益。如果有其他法律问题，也可以直接向我咨询。