结论：在单位干了13年自动离职是否有补偿，需根据自动离职的具体原因和情形来判断，一般情况下，若因个人原因主动离职，通常没有经济补偿；但若因单位存在违法行为或未提供必要劳动条件等导致离职，则可能有补偿。以下是对此问题的详细分析：
一、个人原因主动离职的情况
法律背景：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者因个人原因主动提出解除劳动合同的，通常不享有经济补偿。这是因为经济补偿主要是为了保障劳动者在因用人单位原因导致劳动合同解除或终止时的合法权益。
具体情形：
- 如果您是因为个人职业规划、家庭原因等主动向单位提出离职，并且单位没有违反法律法规或劳动合同的行为，那么您通常无法获得经济补偿。
二、单位原因导致离职的情况
法律背景：
- 同样根据《中华人民共和国劳动合同法》，如果用人单位存在违法行为，如未及时足额支付劳动报酬、未依法为劳动者缴纳社会保险费、未按照劳动合同约定提供劳动保护或者劳动条件等，劳动者可以解除劳动合同，并有权要求用人单位支付经济补偿。
具体情形及补偿计算：
- 未及时足额支付劳动报酬：如果单位长期拖欠工资或未足额支付，您可以以此为由提出离职，并要求单位支付经济补偿。经济补偿的计算方式为：按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。因此，您工作了13年，如果符合这一情形，应获得13个月工资的经济补偿。
- 未依法缴纳社会保险费：如果单位未依法为您缴纳社会保险费，您也可以提出离职并要求经济补偿，补偿计算方式同上。
- 未提供劳动保护或劳动条件：如果单位未按照劳动合同约定提供必要的劳动保护或劳动条件，导致您无法继续工作，您同样可以提出离职并要求经济补偿。
三、特殊情形下的补偿
- 协商一致解除劳动合同：如果双方协商一致解除劳动合同，并且是由单位提出解除的，那么您也有权获得经济补偿，补偿标准同样按照工作年限和月工资来计算。但如果是您主动提出协商解除，且单位没有过错，则通常没有补偿。
四、建议与行动
- 收集证据：如果您认为单位存在违法行为或未提供必要劳动条件等导致您离职，建议您先收集相关证据，如工资条、社保缴纳记录、劳动合同、工作条件照片或视频等。
- 与单位协商：在收集到足够证据后，您可以先与单位进行协商，看是否能够达成和解并获得应有的补偿。
- 申请劳动仲裁：如果协商无果，您可以向当地劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
最后，每个案件的具体情况都有所不同，因此在实际操作中，建议您根据自身情况咨询专业律师（即向我咨询），以便更准确地了解自己的权益和可能的补偿金额。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我提问。