结论：入职没有签合同，平时请假扣双倍工资一般是不合法的。下面我将从多个角度为你详细分析这个问题。
一、关于未签订劳动合同的法律后果
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。这意味着，如果你入职后公司一直未与你签订劳动合同，你有权要求公司支付未签订劳动合同期间的双倍工资差额。这一规定旨在保护劳动者的权益，确保劳动合同的签订，从而明确双方的权利和义务。
二、关于请假扣双倍工资的合法性
一般情况下的工资扣除：
- 劳动者请假，用人单位扣除工资应当遵循合理、合法的原则。通常，用人单位会根据劳动者的请假类型（如事假、病假等）和公司的规章制度来决定扣除的工资数额。
- 一般情况下，事假期间用人单位可以不支付工资，但扣除的工资数额不应超过劳动者正常工作日的工资。病假期间，用人单位则应按照相关规定支付病假工资，通常不会扣除双倍工资。
扣双倍工资的合法性分析：
- 扣除双倍工资的做法缺乏法律依据，且可能违反劳动法的相关规定。劳动法旨在保护劳动者的合法权益，确保劳动者在提供劳动后获得相应的报酬。扣除双倍工资无疑是对劳动者权益的侵害。
- 如果公司的规章制度中明确规定了请假扣双倍工资的条款，且该条款未违反法律法规的强制性规定，那么从合同自治的角度来看，该条款可能在一定程度上具有约束力。然而，在实际操作中，这样的条款往往因为显失公平而被认定为无效。因为劳动者在签订劳动合同时往往处于弱势地位，难以对这样的不公平条款提出异议。
- 更重要的是，由于你与公司之间并未签订书面劳动合同，因此公司的规章制度对你并不必然产生约束力。在这种情况下，公司扣除你双倍工资的做法更是缺乏法律依据。
三、建议与行动
与公司协商：
- 你可以首先尝试与公司进行协商，明确表达你的诉求和理由。要求公司按照法律法规的规定支付你未签订劳动合同期间的双倍工资差额，并停止扣除你双倍工资的做法。
向劳动监察部门投诉：
- 如果协商无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉。劳动监察部门有权对用人单位的违法行为进行调查和处理，并可以要求用人单位改正违法行为、支付赔偿金等。
申请劳动仲裁：
- 你还可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。劳动仲裁是解决劳动争议的一种有效方式，仲裁委员会会根据事实和法律法规作出公正的裁决。
在处理这类问题时，建议你保留好相关证据，如工资条、考勤记录、请假条等，以便在需要时提供证明。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。