结论：入职超过一年未签劳动合同，劳动者在特定条件下仍有权申请双倍工资差额，但需特别注意仲裁时效的限制。

一、法律依据与基础分析

根据《中华人民共和国劳动合同法》第八十二条的规定，用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。这一规定旨在保护劳动者的合法权益，防止用人单位通过不签订劳动合同来规避法律责任。同时，该法还规定，用人单位自用工之日起满一年不与劳动者订立书面劳动合同的，视为已订立无固定期限劳动合同。

二、双倍工资差额的申请条件与计算

1. 申请条件：

   • 用人单位未在用工之日起一个月内与劳动者签订书面劳动合同。
   • 未签订合同的责任在于用人单位，而非劳动者拒绝签订或双方协商一致不签订。
   • 劳动者需提供证据证明与用人单位存在事实劳动关系，如考勤记录、工作证、工资条等。

2. 计算方式：

   • 起算时间：从用工满一个月的次日起开始计算双倍工资差额。
   • 截止时间：对于入职超过一年未签合同的情况，双倍工资差额的截止时间为用工之日起满一年的前一日。因为根据法律规定，满一年后视为已订立无固定期限劳动合同，此时不再适用双倍工资差额的规定。
   • 基数确定：通常以劳动者当月应得工资为计算基数，包括计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴等货币性收入。具体计算时，需扣除加班工资、非常规性奖金、福利性风险性项目后的正常工作时间月工资，但部分地区如北京、江苏等地认为应以对应月份的应得工资为准，包括所有工资组成部分。

三、仲裁时效的限制

劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。对于未签订劳动合同的双倍工资主张，这一时效同样适用。因此，劳动者需在入职满一年后的次日起一年内提出仲裁申请，否则可能因超过时效而无法获得支持。

四、实际案例与司法实践

在实际案例中，法院会根据具体情况判断劳动者主张双倍工资差额的请求是否成立。例如，在某些案例中，尽管劳动者入职多年未签订劳动合同，但由于超过了仲裁时效，其请求被驳回。而在另一些案例中，劳动者在法定期限内提出了仲裁申请，并成功获得了双倍工资差额的赔偿。

五、建议与注意事项

1. 及时维权：劳动者应关注自己的权益，一旦发现用人单位未依法签订书面劳动合同，应及时通过法律途径维护自己的合法权益，特别注意仲裁时效的限制。
2. 保留证据：劳动者应保留好与用人单位存在劳动关系的证据，如工作证、考勤记录、工资条等，以便在需要时提供证明。
3. 了解当地政策：不同地区的司法实践可能存在差异，劳动者应了解当地的政策和法规，以便更好地维护自己的权益。例如，部分地区对于双倍工资差额的计算基数或时效起算点可能有特殊规定。

六、特殊情况说明

如果劳动者因用人单位原因（如遗漏、不明确法律规定等）未签订劳动合同，且劳动者在仲裁时效内主张权利的，通常可以获得未签订期间（最长不超过11个月）的双倍工资差额。但如果因劳动者原因（如拒绝签订、协商一致不签订等）导致未签订劳动合同的，则可能无法获得双倍工资差额的支持。

综上所述，入职超过一年未签劳动合同的劳动者，在特定条件下仍有权申请双倍工资差额，但需特别注意仲裁时效的限制和当地司法实践的具体规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。