结论前置：员工提前中止合同，公司不能直接扣除全部培训费，具体处理方式需依据合同约定及法律规定来判断。员工对此有异议，可以通过协商、劳动仲裁或诉讼等途径解决。
一、合同约定与法律规定
合同约定：
- 首先，需要查看员工与公司签订的劳动合同中，关于培训费扣除的具体条款。如果合同中有明确约定，员工提前解除合同需承担一定比例的培训费用，那么这一约定在合法范围内是有效的。但约定的扣除比例应当合理，不能显失公平。
法律规定：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以与该劳动者订立协议，约定服务期。劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。但违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用，且用人单位要求劳动者支付的违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。
二、员工异议的处理方式
协商：
- 员工对公司扣除全部培训费有异议时，首先可以尝试与公司进行协商，表达自己的观点和理由，寻求双方都能接受的解决方案。
劳动仲裁：
- 如果协商无果，员工可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。在仲裁过程中，员工需要提供相关证据，如劳动合同、培训协议、培训费用支付凭证等，以证明自己的主张。仲裁委员会将根据事实和法律规定，作出裁决。
诉讼：
- 如果员工对劳动仲裁结果不满意，还可以向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，同样需要提供充分的证据来支持自己的主张。法院将依法审理案件，并作出判决。
三、具体案例分析
- 假设员工与公司签订的劳动合同中约定，员工需为公司服务3年，公司为员工提供了价值5万元的专项培训。员工在服务1年后提前解除合同，公司要求员工支付剩余2年服务期所应分摊的培训费用，即约3.33万元（5万元/3年*2年）。这一要求在法律上是合理的，因为员工违反了服务期约定。但如果公司要求员工支付全部5万元培训费用，则可能超出法律规定的范围。
四、建议
- 对于员工而言，在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于培训费扣除的约定。如果认为合同条款不合理或存在歧义，应及时与公司沟通并寻求修改。
- 对于公司而言，在制定劳动合同和培训协议时，应确保条款的合法性和合理性，避免过度扣除员工的培训费用，以免引发劳动争议。
五、进一步行动
- 如果您作为员工或公司代表，在处理此类问题时遇到困难或疑问，可以直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业的法律建议和解决方案。