结论：教员协议中提前终止合作扣除剩余全部未发劳务费用，并要求赔偿甲方的条款，其合法性需根据具体情况判断，但一般情况下，扣除全部未发劳务费用并额外要求赔偿可能涉嫌违法或不合理。以下从不同角度进行分析：
一、合同条款的合法性分析
合同自由原则与限制：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同双方在平等、自愿的基础上可以约定合同条款，但这些条款不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。
- 若协议中扣除全部未发劳务费用并要求赔偿的条款，明显加重了教员一方的责任，而减轻了甲方的责任，可能因显失公平而被认定为无效条款。
劳务费用的支付与扣除：
- 劳务费用是教员提供劳务后应得的报酬，除非有法定或约定的扣除情形，否则甲方无权扣除。
- 若协议中未明确约定提前终止合作时扣除全部未发劳务费用的情形，或该约定违反法律、行政法规的强制性规定，则甲方扣除劳务费用的行为可能构成违法。
二、赔偿责任的合理性分析
赔偿责任的构成要件：
- 赔偿责任通常要求存在违约行为、损害后果以及违约行为与损害后果之间的因果关系。
- 若教员提前终止合作并未给甲方造成实际损失，或甲方无法证明其损失与教员提前终止合作之间存在因果关系，则要求教员赔偿可能缺乏法律依据。
赔偿范围的合理性：
- 即使教员提前终止合作构成违约，赔偿范围也应限于甲方因违约行为所遭受的实际损失。
- 若协议中约定的赔偿范围明显超出甲方实际损失，可能因赔偿范围不合理而被认定为无效条款。
三、实际操作建议
审查协议条款：
- 教员应仔细审查协议中的相关条款，特别是关于提前终止合作、劳务费用支付与扣除、赔偿责任等方面的约定。
- 若发现条款存在违法或不合理之处，应及时与甲方协商修改或解除协议。
协商与调解：
- 在发生争议时，双方应首先尝试通过协商或调解的方式解决纠纷。
- 协商或调解过程中，可以邀请第三方机构或专业人士参与，以促成双方达成公平合理的解决方案。
法律途径：
- 若协商或调解无果，教员可以向劳动仲裁机构申请仲裁或向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
- 在法律程序中，教员应提供充分的证据证明自己的主张，并遵循法律程序和规定。
进一步思考：在实际操作中，教员与甲方之间的协议往往受到多种因素的影响，包括但不限于双方的市场地位、谈判能力、行业惯例等。因此，在判断协议条款的合法性和合理性时，需要综合考虑多种因素。若教员对协议条款存在疑问或担忧，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议。有问题可以直接向我咨询，我会结合你的具体情况为你详细解答。