核心结论：同事休年假期间，您代其上班的工资及权益计算需分情况讨论，具体如下：

1. 若单位安排代班且未额外支付工资

根据《劳动法》第四十四条及《企业职工带薪年休假实施办法》相关规定：

• 法定加班情形：若代班导致您在法定节假日、休息日或延长工作时间工作，单位应按以下标准支付加班费：
  • 法定节假日：不低于工资的300%；
  • 休息日：不低于工资的200%（若不能补休）；
  • 延长工作时间：不低于工资的150%。
• 非加班情形：若代班未超出正常工作时间（如同事A休年假，您接替其部分工作但总工时未超标），单位无需额外支付工资，但需确保您的总工时不超过法定上限（每日≤8小时，每周≤40小时）。

建议：保留考勤记录、代班工作安排通知等证据，若单位未支付加班费，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

2. 若单位与您协商一致代班并约定报酬

• 书面协议优先：若您与单位签订书面协议，明确代班期间的工作内容、报酬标准及支付方式，单位应按协议履行。
• 口头协议风险：若仅为口头约定，需通过聊天记录、邮件等证据证明双方合意，否则可能面临举证困难。

建议：代班前与单位签订书面协议，避免口头约定；若已发生纠纷，可收集同事证言、工作记录等证据维权。

3. 若代班导致您权益受损（如超时工作）

• 超时工作认定：若代班使您每周工作时间超过40小时，或每日超过8小时，单位需支付加班费或安排补休。
• 健康权保护：若长期代班导致您身体不适，可依据《职业病防治法》要求单位调整工作安排，并保留医疗记录作为证据。

建议：及时向单位提出调整工作安排的请求，并留存书面记录；若单位拒绝，可向当地劳动保障部门举报。

4. 特殊情形：同事休年假期间您完全接替其岗位

• 岗位接替性质：若您临时接替同事岗位，但劳动合同未变更，单位无需支付额外工资，但需确保您的总工时合法。
• 劳动合同变更：若接替岗位导致劳动合同内容变更（如工作内容、薪资标准），需双方协商一致并签订书面变更协议。

建议：接替岗位前确认劳动合同是否需要变更，避免后续纠纷。

总结：同事休年假期间您代班，工资及权益计算需结合代班性质（是否加班、是否协商报酬等）及证据留存情况。若单位未依法支付报酬或安排超时工作，您可通过法律途径维权。如有具体案例或证据，可进一步向我咨询，我将为您详细分析。