用人单位与用工单位之间有劳务派遣协议时，确实应当从约定，但这种约定必须在法律法规的框架内进行，且需充分保障被派遣劳动者的合法权益。以下是对这一问题的详细分析：
一、劳务派遣协议的法律性质与效力
劳务派遣协议是劳务派遣单位（用人单位）与用工单位之间，为明确双方在被派遣劳动者相关事宜上的权利与义务而签订的重要法律文件。根据《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，该协议具有法律效力，双方必须严格遵守。这意味着，协议中的约定，只要不违反法律法规的强制性规定和公序良俗，就应当被双方所遵循。
二、协议约定的内容与范围
劳务派遣协议应当明确约定以下关键内容：
- 派遣岗位与人员：明确被派遣劳动者的具体工作岗位、工作内容、性质及职责，以及派遣到各岗位的人员数量。
- 派遣期限：精确规定劳务派遣的起止时间，对于长期合作且需求不稳定的情况，可以任务完成为期限，并明确任务完成的标准。同时，约定派遣期限届满后的续签条件、程序及提前终止的情形。
- 劳动报酬与社会保险：明确工资标准、计算方式、支付周期及支付方式，确保不低于当地最低工资标准。详细列出福利待遇，如奖金、津贴、带薪年假等。明确社会保险的险种、缴纳标准、责任方及未依法缴纳的法律责任。
- 工作时间与休息休假：确定工作时间制度，如标准工时制、不定时工作制或综合计算工时工作制，并注明审批情况。详细说明休息休假权利，包括每周休息日、法定节假日等。
- 劳动保护、条件与职业危害防护：提供符合国家规定的劳动安全卫生条件和必要的劳动防护用品。确保工作场所、设备、工具等符合劳动条件。对存在职业危害的岗位采取防护措施，并定期进行职业健康检查。
- 费用与支付：明确劳务派遣服务费用的金额或计算方法，以及支付方式和时间。规定逾期支付的违约责任。
- 人员退回与派遣关系解除：列举用工单位可以将被派遣劳动者退回的具体情形及程序。约定派遣关系解除的条件、程序及经济补偿责任。
三、从约定的限制与保障
虽然劳务派遣协议允许双方从约定，但这种约定并非毫无限制。具体来说：
- 不得违反法律法规：协议中的约定必须严格遵守《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规的规定，不得损害被派遣劳动者的合法权益。例如，不得约定低于当地最低工资标准的工资，不得剥夺被派遣劳动者享受社会保险和福利待遇的权利等。
- 保障劳动者权益：在签订和履行劳务派遣协议时，劳务派遣单位和用工单位必须充分保障被派遣劳动者的合法权益。这包括但不限于工资支付、社会保险缴纳、劳动安全卫生等方面的规定。如果协议中的约定损害了劳动者的权益，那么该约定将被视为无效。
- 禁止分割派遣期限：用工单位不得将连续用工期限分割订立数个短期劳务派遣协议，以防止通过此种方式规避法律责任，损害劳动者权益。
四、实际案例与操作建议
在实际操作中，劳务派遣单位与用工单位应当根据具体的工作需求和双方协商的结果来签订劳务派遣协议。例如，对于临时性、阶段性或项目性的工作任务，双方可以签订以完成一定工作为期限的劳务派遣协议。但在此过程中，必须确保协议的合法性和有效性，并充分保障被派遣劳动者的合法权益。
建议：在签订劳务派遣协议前，双方应充分了解相关法律法规的规定，确保协议的合法性和有效性。同时，在协议履行过程中，双方应严格遵守约定，保障被派遣劳动者的合法权益。如果发生争议或纠纷，双方应首先通过协商或调解的方式解决；如果协商或调解无果，则可以依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。
综上所述，用人单位与用工单位之间有劳务派遣协议时，确实应当从约定，但这种约定必须在法律法规的框架内进行，并充分保障被派遣劳动者的合法权益。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。