个人计件工厂以代打卡开除员工是否合法，需根据具体情况判断，但通常情况下，若代打卡行为严重违反公司规章制度，且规章制度合法有效，工厂以此开除员工可能合法。以下从不同角度进行分析：
一、公司规章制度的角度
规章制度合法性：
- 根据《劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
- 若工厂的规章制度中明确规定了代打卡属于严重违反规章制度的行为，并且该规章制度已经过上述民主程序制定，且已向劳动者公示或告知，那么该规章制度对劳动者具有约束力。
规章制度执行：
- 若员工确实存在代打卡行为，且该行为被工厂查实，工厂有权依据规章制度对员工进行处罚。若规章制度中明确规定了代打卡可予以开除，且该处罚与员工行为的性质、情节以及社会危害程度相适应，那么工厂以此开除员工可能合法。
二、员工行为的角度
代打卡行为的性质：
- 代打卡行为通常被视为一种不诚信、违反劳动纪律的行为。它不仅损害了工厂的考勤管理制度，也可能影响工厂的正常运营秩序。
- 若代打卡行为涉及虚假考勤，还可能构成欺诈行为，损害工厂的利益。
员工行为的后果：
- 若员工因代打卡行为被工厂开除，且该开除决定符合工厂规章制度的规定，那么员工可能难以主张工厂违法解除劳动合同。
- 但若员工认为工厂的开除决定违法或不合理，可以依法向劳动争议调解仲裁机构申请调解仲裁，对仲裁裁决不服的，还可以向人民法院提起诉讼。
三、法律建议
对于工厂：
- 工厂应制定合法、合理、明确的规章制度，并确保规章制度经过民主程序制定且已向劳动者公示或告知。
- 在处理员工代打卡等违纪行为时，应确保处理程序合法、公正、透明，避免滥用开除等严厉处罚措施。
对于员工：
- 员工应遵守工厂的规章制度，诚实守信地履行劳动义务。
- 若因代打卡等行为被工厂处罚或开除，员工应了解自己的合法权益，并在必要时寻求法律援助或咨询专业律师。
总结来说，个人计件工厂以代打卡开除员工是否合法，需根据工厂的规章制度、员工的行为性质以及处理程序等因素综合判断。若工厂规章制度合法有效且已向员工公示或告知，员工确实存在代打卡行为且该行为严重违反规章制度，工厂以此开除员工可能合法。但若存在任何违法或不合理之处，员工均有权依法维护自己的合法权益。如有具体法律问题，可以直接向我咨询。