医患纠纷的三方协议中，若患者和医院双方都已签字盖章，而第三方未盖章，该协议的效力需根据第三方的身份及协议性质进行具体分析，一般情况下，若第三方为必要参与方且未盖章，则协议可能不生效或存在效力瑕疵。以下是对此问题的详细分析：
一、第三方身份对协议效力的影响
第三方为必要参与方：
- 在某些医患纠纷中，第三方可能扮演着关键角色，如调解机构、鉴定机构或保险公司等。若协议明确约定第三方的参与是协议生效的必要条件，且第三方未在协议上盖章，则该协议可能因缺乏必要参与方的确认而无效或存在效力瑕疵。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同生效需满足当事人意思表示真实、不违反法律或行政法规的强制性规定等条件。若第三方作为必要参与方未盖章，可能影响合同意思表示的完整性，从而影响合同效力。
第三方为非必要参与方：
- 若第三方在协议中并非必要参与方，其未盖章可能不影响协议的效力。此时，协议主要约束患者和医院双方，只要双方意思表示真实且不违反法律规定，协议即具有法律效力。
二、协议性质对效力的影响
调解协议：
- 若三方协议为调解协议，且第三方为调解机构，其未盖章可能影响调解协议的正式性和执行力。但根据《人民调解法》等相关规定，调解协议经双方当事人签字或盖章后即具有法律约束力，第三方调解机构的盖章并非绝对必要条件（除非协议有特别约定）。然而，在实际操作中，调解机构的盖章往往被视为对调解结果的确认和背书，有助于增强协议的执行力。
和解协议：
- 若三方协议为和解协议，且第三方仅为见证方或协助方，其未盖章通常不影响协议的效力。和解协议主要体现患者和医院双方的合意，第三方未盖章不影响双方权利义务的设定和履行。
三、法律建议
审查协议条款：
- 在签订三方协议前，应仔细审查协议条款，明确第三方的身份、角色及协议生效的条件。若第三方为必要参与方，应确保其在协议上盖章或签字确认。
咨询专业律师：
- 鉴于医患纠纷的复杂性和敏感性，建议在签订三方协议前咨询专业律师，以确保协议的合法性和有效性。律师可以根据具体情况提供针对性的法律建议和风险评估。
保留证据：
- 在签订协议过程中，应保留好相关证据，如协议文本、沟通记录等。以便在协议履行过程中或发生争议时，能够证明各方的权利义务和协议内容。
若您在医患纠纷中遇到类似问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况提供专业的法律意见和解决方案。