针对您提出的“公司检查卫生罚款是否合法”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

一、公司因卫生问题罚款的通常不合法性

在大多数情况下，公司因卫生问题对员工进行罚款是不合法的。这主要是因为：

1. 缺乏法律依据：罚款作为一种行政处罚权，仅由具备行政处罚权的行政机关或法律授权的组织行使。公司作为民事主体，并不具备这样的权力。因此，公司随意对员工进行罚款，缺乏法律支撑。

2. 违背劳动合同关系本质：劳动者与用人单位之间是基于劳动合同建立的平等民事主体关系。用人单位不能未经法定程序和约定，就随意扣除劳动者的工资。工资是劳动者通过劳动获得的报酬，用人单位有义务按照劳动合同约定足额支付。

二、公司因卫生问题罚款可能合法的特殊情况

尽管在大多数情况下公司罚款不合法，但在特定条件下，罚款行为可能被视为合法。这主要包括：

1. 规章制度明确规定且合理：如果公司在依法制定的规章制度中明确规定了卫生不达标的具体情形及相应的罚款措施，并且该规章制度制定程序合法（如经过职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定，并进行公示或告知劳动者），同时罚款金额合理且不影响劳动者基本生活，那么公司依据此规章制度进行的罚款可能被认定有效。

2. 造成公司实际损失：若因卫生问题导致公司遭受实际经济损失，如客户投诉、业务受损等，公司可以要求劳动者赔偿损失。但赔偿需遵循一定程序，如先进行损失评估，经劳动者确认后从工资中扣除，且每月扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。

三、公司的合法处理方式

如果员工违反公司卫生规定，公司应采取合法手段进行处理，而非直接罚款。例如：

• 进行批评教育，提醒员工注意卫生问题；
• 依据劳动合同中的约定，扣发奖金或其他福利；
• 在严重情况下，可以依据劳动合同法的相关规定解除劳动合同。

四、员工权益保护

员工在面对公司的不合法罚款时，有权采取以下措施维护自己的合法权益：

• 与公司进行沟通协商，要求其说明罚款依据；
• 向劳动监察部门投诉，寻求政府部门的帮助；
• 申请劳动仲裁，通过法律途径解决争议；
• 如对仲裁结果不满，可在规定时间内向法院提起诉讼，维护自己的合法权益。

总结：公司因卫生问题对员工进行罚款需谨慎行事，确保行为合法合规。员工也应了解自己的权益，并在面对不合法罚款时积极采取措施维护自身权益。公司应依法管理员工，通过合法手段促进员工遵守公司规定和劳动纪律。