针对您提出的“员工走私单怎么赔偿”的问题，这是一个涉及法律责任和赔偿机制的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：
员工走私单行为，即员工未经公司正规流程和规定，私下与客户进行交易以谋取私利，这种行为不仅违反了公司的规章制度，还可能触及多个法律层面，因此，员工需要承担相应的法律责任和赔偿义务。
一、民事责任赔偿
违反合同约定赔偿：
- 员工与公司签订的劳动合同或其他协议中，通常包含禁止私自接单、损害公司利益等条款。一旦员工走私单，就构成了违约行为。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，员工应承担继续履行、采取补救措施或赔偿损失等违约责任。公司有权要求员工赔偿因其走私单行为给公司造成的所有经济损失，包括但不限于直接损失和间接损失。
侵犯商业秘密赔偿：
- 若员工在走私单过程中使用了公司的商业秘密，如客户名单、产品配方、技术秘密等，则构成对公司商业秘密的侵犯。根据《民法典》的相关规定，员工需赔偿公司因商业秘密泄露所遭受的损失。损失的计算可以按照市场价格、侵权所得利益或其他合理方式来确定。
不正当竞争赔偿：
- 依据《中华人民共和国反不正当竞争法》，员工走私单行为若给公司的市场竞争地位造成损害，属于不正当竞争行为。公司有权要求员工承担民事责任，赔偿数额按实际损失或侵权所得利益来确定。
二、劳动法律责任
- 解除劳动合同：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》，员工走私单行为严重违反公司规章制度的，公司有权解除劳动合同，且无需支付经济补偿。这是公司对员工违规行为的一种严厉制裁措施。
三、刑事责任赔偿（若构成犯罪）
职务侵占罪赔偿：
- 如果员工利用职务之便，将本应属于公司的业务私自承接并获取利益，且数额较大，可能构成职务侵占罪。依据《中华人民共和国刑法》的相关规定，员工除了需要承担刑事责任外，还可能需要赔偿公司因此遭受的损失。
侵犯商业秘密罪赔偿：
- 若员工走私单时侵犯公司商业秘密，给公司造成重大损失，可能构成侵犯商业秘密罪。根据《刑法》的相关规定，员工同样需要承担刑事责任，并可能需要赔偿公司因此遭受的损失。
四、行政责任赔偿（若涉及行政违法）
- 行政处罚赔偿：
- 若走私单行为涉及偷逃税款或违反海关监管规定等行政违法行为，员工还可能受到税务部门或海关的行政处罚，如罚款、没收违法所得等。这些行政处罚也可能间接导致员工需要承担一定的赔偿责任。
综合建议：
公司在发现员工走私单行为时，应及时咨询专业律师的意见，以便采取合适的法律措施来维护公司的合法权益。同时，公司应加强内部管理和监督，建立健全的规章制度和防控机制，明确员工的行为规范，加强法律培训，提高员工的法律意识，从源头上预防类似行为的发生。对于已经发生的走私单行为，公司应依法追究员工的责任，并要求其承担相应的赔偿责任。