结论前置：当员工不能胜任工作，经过培训后仍然不能胜任的，用人单位在符合法定程序的情况下可以解除劳动合同，并且需要向员工支付经济补偿。

一、法律依据与程序要求

根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十条的规定，劳动者不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位，仍不能胜任工作的，用人单位提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，可以解除劳动合同。这一条款明确了用人单位在员工不能胜任工作时的解除权，但同时也设定了严格的程序要求，即必须提前通知或支付代通知金。

二、经济补偿的计算标准与支付方式

1. 计算标准：

   • 经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，以每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
   • 这里的月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。若劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，经济补偿的标准将按职工月平均工资三倍的数额支付，且支付经济补偿的年限最高不超过十二年。

2. 支付方式：

   • 经济补偿金通常以货币形式一次性支付给劳动者，且用人单位应在与劳动者办结工作交接时支付。

三、实际操作中的注意事项

1. 明确不能胜任工作的标准：

   • 用人单位应制定明确、具体、可衡量的工作要求和岗位标准，并在劳动合同、员工手册或岗位说明书中明确约定。这样，在评估员工是否胜任工作时，才能有客观、公正的标准。

2. 保留培训记录与评估证据：

   • 培训内容应与员工不能胜任的工作内容紧密相关，具有针对性。同时，用人单位应保留培训记录，包括培训时间、地点、内容、参与人员等，以证明培训的真实性和有效性。此外，用人单位还应保留对员工工作表现的评估证据，如绩效考核结果、工作任务完成情况记录等，以证明员工经过培训后仍然不能胜任工作。

3. 遵循法定程序与沟通协商：

   • 在解除劳动合同前，用人单位应提前三十日以书面形式通知劳动者本人，或选择支付代通知金。同时，用人单位应与员工进行充分沟通，尽量达成双方都能接受的解决方案。如果员工对解除劳动合同有异议，用人单位应耐心解释，并告知员工其享有的法律权益和救济途径。

四、违法解除的后果

如果用人单位未遵循法定程序或未支付经济补偿而解除劳动合同，可能构成违法解除。根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，违法解除劳动合同的，用人单位可能需要支付赔偿金，即双倍的经济补偿金。因此，用人单位在解除劳动合同时，必须严格遵守法律法规，确保程序的合法性与正当性。

举例说明：假设某员工在用人单位工作了3年，月工资为5000元。因不能胜任工作，经过培训后仍然不能胜任。用人单位决定解除劳动合同，并提前三十日书面通知了该员工。那么，用人单位应向该员工支付的经济补偿为：3年×5000元/年=15000元。如果用人单位未提前三十日书面通知而直接解除劳动合同，则还需要额外支付一个月工资作为代通知金，即总共需要支付20000元。

总结与建议：作为用人单位，在面对员工不能胜任工作的情况时，应首先尝试通过培训或调整工作岗位来帮助员工提升能力。如果经过努力后员工仍然不能胜任工作，再考虑解除劳动合同。在解除劳动合同时，务必遵循法定程序，确保程序的合法性与正当性，并依法支付经济补偿。如果员工对解除劳动合同有异议或提出法律诉求，建议用人单位及时咨询专业律师，以维护自身的合法权益。您有任何劳动纠纷相关的问题，都可以直接向我咨询。