结论：您对公司辞退但写协商一致的通知有异议并已勾选有异议可以起诉，这是正确的做法。接下来，您需要积极准备相关证据，通过法律途径维护自己的权益。以下是对此问题的详细分析：
一、法律背景与权益分析
- 辞退与协商一致的区别：
- 辞退：通常指公司单方面解除与员工的劳动关系，可能涉及违法辞退、经济性裁员、员工严重违纪等多种情形。
- 协商一致：指公司与员工在平等自愿的基础上，就解除劳动关系达成一致意见，并签订相关协议。
若公司实际是辞退您，但通知书上却写协商一致，这可能构成对事实的歪曲，影响您的权益，如经济补偿、失业保险等。
- 您的异议权：
- 您对通知书有异议，并已勾选有异议可以起诉，这是您的合法权利。根据《劳动争议调解仲裁法》等相关法律法规，您有权对公司的决定提出异议，并通过法律途径解决争议。
二、后续行动建议
收集证据：
- 保留好公司发出的通知书、您与公司之间的沟通记录（如邮件、短信、微信等）、工作记录、工资单等证据，以证明公司实际是辞退您，而非协商一致。
- 如果可能，寻找同事或证人，以证明公司辞退您的事实。
提起劳动仲裁或诉讼：
- 根据《劳动争议调解仲裁法》的规定，您可以先向当地的劳动争议仲裁委员会提起仲裁申请，要求确认公司辞退您的行为违法，并要求公司支付相应的经济补偿或赔偿金。
- 如果对仲裁结果不满意，您还可以在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。
注意时效限制：
- 劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从您知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。因此，请务必在时效期间内提起仲裁或诉讼。
三、可能的法律后果
如果公司确实违法辞退您：
- 公司可能需要支付您经济补偿金或赔偿金，具体数额根据您的工龄、工资等因素确定。
- 您还有权要求公司恢复劳动关系或支付违法解除劳动关系的赔偿金。
如果公司能够证明是协商一致解除劳动关系：
- 但若您无法提供充分证据证明公司实际是辞退您，且公司能够提供协商一致的证据（如双方签订的解除劳动关系协议），则您可能无法获得经济补偿或赔偿金。
- 因此，证据的收集和保存至关重要。
最后，我建议您尽快咨询专业律师（即向我咨询），以便更详细地了解您的权益和可能的法律后果，并制定更具体的维权策略。在处理此类劳动纠纷时，专业律师的指导和帮助将对您非常有利。